Protein–RNA interactions for Protein: Q01780

EXOSC10, Exosome component 10, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 885 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC10Q01780 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
EXOSC10Q01780 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
EXOSC10Q01780 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
EXOSC10Q01780 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
EXOSC10Q01780 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
EXOSC10Q01780 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
EXOSC10Q01780 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
EXOSC10Q01780 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
EXOSC10Q01780 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
EXOSC10Q01780 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
EXOSC10Q01780 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
EXOSC10Q01780 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
EXOSC10Q01780 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
EXOSC10Q01780 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
EXOSC10Q01780 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
EXOSC10Q01780 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
EXOSC10Q01780 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
EXOSC10Q01780 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
EXOSC10Q01780 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
EXOSC10Q01780 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
EXOSC10Q01780 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
EXOSC10Q01780 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC20.27■□□□□ 0.84
EXOSC10Q01780 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
EXOSC10Q01780 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
EXOSC10Q01780 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
EXOSC10Q01780 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
EXOSC10Q01780 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
EXOSC10Q01780 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
EXOSC10Q01780 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
EXOSC10Q01780 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
EXOSC10Q01780 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC20.27■□□□□ 0.83
EXOSC10Q01780 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
EXOSC10Q01780 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
EXOSC10Q01780 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
EXOSC10Q01780 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
EXOSC10Q01780 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
EXOSC10Q01780 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
EXOSC10Q01780 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
EXOSC10Q01780 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
EXOSC10Q01780 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
EXOSC10Q01780 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
EXOSC10Q01780 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
EXOSC10Q01780 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
EXOSC10Q01780 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
EXOSC10Q01780 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
EXOSC10Q01780 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
EXOSC10Q01780 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
EXOSC10Q01780 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
EXOSC10Q01780 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
EXOSC10Q01780 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
EXOSC10Q01780 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
EXOSC10Q01780 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
EXOSC10Q01780 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
EXOSC10Q01780 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
EXOSC10Q01780 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
EXOSC10Q01780 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
EXOSC10Q01780 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
EXOSC10Q01780 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
EXOSC10Q01780 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
EXOSC10Q01780 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
EXOSC10Q01780 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
EXOSC10Q01780 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
EXOSC10Q01780 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
EXOSC10Q01780 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
EXOSC10Q01780 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
EXOSC10Q01780 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
EXOSC10Q01780 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
EXOSC10Q01780 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
EXOSC10Q01780 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
EXOSC10Q01780 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
EXOSC10Q01780 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
EXOSC10Q01780 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
EXOSC10Q01780 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
EXOSC10Q01780 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
EXOSC10Q01780 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
EXOSC10Q01780 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
EXOSC10Q01780 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
EXOSC10Q01780 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
EXOSC10Q01780 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
EXOSC10Q01780 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
EXOSC10Q01780 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
EXOSC10Q01780 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
EXOSC10Q01780 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
EXOSC10Q01780 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
EXOSC10Q01780 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
EXOSC10Q01780 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
EXOSC10Q01780 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
EXOSC10Q01780 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
EXOSC10Q01780 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
EXOSC10Q01780 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
EXOSC10Q01780 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
EXOSC10Q01780 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
EXOSC10Q01780 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
EXOSC10Q01780 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
EXOSC10Q01780 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
EXOSC10Q01780 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
EXOSC10Q01780 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
EXOSC10Q01780 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
EXOSC10Q01780 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
EXOSC10Q01780 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.5 ms