Protein–RNA interactions for Protein: Q01118

SCN7A, Sodium channel protein type 7 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,682 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN7AQ01118 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SCN7AQ01118 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SCN7AQ01118 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SCN7AQ01118 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
SCN7AQ01118 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SCN7AQ01118 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SCN7AQ01118 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SCN7AQ01118 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SCN7AQ01118 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SCN7AQ01118 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SCN7AQ01118 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SCN7AQ01118 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SCN7AQ01118 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SCN7AQ01118 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SCN7AQ01118 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SCN7AQ01118 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SCN7AQ01118 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SCN7AQ01118 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SCN7AQ01118 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SCN7AQ01118 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SCN7AQ01118 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SCN7AQ01118 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SCN7AQ01118 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SCN7AQ01118 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SCN7AQ01118 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SCN7AQ01118 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SCN7AQ01118 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SCN7AQ01118 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SCN7AQ01118 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SCN7AQ01118 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SCN7AQ01118 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SCN7AQ01118 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SCN7AQ01118 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SCN7AQ01118 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SCN7AQ01118 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SCN7AQ01118 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SCN7AQ01118 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SCN7AQ01118 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SCN7AQ01118 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SCN7AQ01118 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SCN7AQ01118 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SCN7AQ01118 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SCN7AQ01118 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SCN7AQ01118 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SCN7AQ01118 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SCN7AQ01118 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SCN7AQ01118 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SCN7AQ01118 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SCN7AQ01118 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SCN7AQ01118 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SCN7AQ01118 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SCN7AQ01118 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SCN7AQ01118 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SCN7AQ01118 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SCN7AQ01118 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SCN7AQ01118 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SCN7AQ01118 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SCN7AQ01118 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SCN7AQ01118 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SCN7AQ01118 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SCN7AQ01118 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SCN7AQ01118 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SCN7AQ01118 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SCN7AQ01118 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SCN7AQ01118 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SCN7AQ01118 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SCN7AQ01118 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SCN7AQ01118 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SCN7AQ01118 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SCN7AQ01118 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SCN7AQ01118 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SCN7AQ01118 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SCN7AQ01118 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SCN7AQ01118 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SCN7AQ01118 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SCN7AQ01118 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SCN7AQ01118 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SCN7AQ01118 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SCN7AQ01118 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SCN7AQ01118 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SCN7AQ01118 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SCN7AQ01118 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SCN7AQ01118 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SCN7AQ01118 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SCN7AQ01118 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SCN7AQ01118 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SCN7AQ01118 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SCN7AQ01118 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SCN7AQ01118 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1
SCN7AQ01118 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1
SCN7AQ01118 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SCN7AQ01118 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1
SCN7AQ01118 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
SCN7AQ01118 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1
SCN7AQ01118 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SCN7AQ01118 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC21.33■■□□□ 1
SCN7AQ01118 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
SCN7AQ01118 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC21.33■■□□□ 1
SCN7AQ01118 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
SCN7AQ01118 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.7 ms