Protein–RNA interactions for Protein: P61960

UFM1, Ubiquitin-fold modifier 1, humanhuman

Predictions only

Length 85 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UFM1P61960 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
UFM1P61960 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
UFM1P61960 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
UFM1P61960 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
UFM1P61960 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
UFM1P61960 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
UFM1P61960 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
UFM1P61960 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
UFM1P61960 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
UFM1P61960 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
UFM1P61960 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
UFM1P61960 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
UFM1P61960 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
UFM1P61960 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
UFM1P61960 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
UFM1P61960 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
UFM1P61960 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
UFM1P61960 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
UFM1P61960 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
UFM1P61960 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
UFM1P61960 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
UFM1P61960 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
UFM1P61960 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
UFM1P61960 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
UFM1P61960 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
UFM1P61960 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
UFM1P61960 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
UFM1P61960 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
UFM1P61960 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
UFM1P61960 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
UFM1P61960 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
UFM1P61960 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
UFM1P61960 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
UFM1P61960 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
UFM1P61960 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
UFM1P61960 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
UFM1P61960 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
UFM1P61960 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
UFM1P61960 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
UFM1P61960 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
UFM1P61960 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
UFM1P61960 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
UFM1P61960 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
UFM1P61960 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
UFM1P61960 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
UFM1P61960 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
UFM1P61960 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
UFM1P61960 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
UFM1P61960 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
UFM1P61960 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
UFM1P61960 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
UFM1P61960 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
UFM1P61960 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
UFM1P61960 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
UFM1P61960 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
UFM1P61960 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
UFM1P61960 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
UFM1P61960 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
UFM1P61960 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
UFM1P61960 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
UFM1P61960 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
UFM1P61960 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
UFM1P61960 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
UFM1P61960 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
UFM1P61960 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
UFM1P61960 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
UFM1P61960 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
UFM1P61960 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
UFM1P61960 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
UFM1P61960 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
UFM1P61960 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
UFM1P61960 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
UFM1P61960 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
UFM1P61960 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
UFM1P61960 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
UFM1P61960 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
UFM1P61960 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
UFM1P61960 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
UFM1P61960 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
UFM1P61960 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
UFM1P61960 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
UFM1P61960 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
UFM1P61960 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
UFM1P61960 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
UFM1P61960 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
UFM1P61960 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
UFM1P61960 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
UFM1P61960 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
UFM1P61960 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
UFM1P61960 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
UFM1P61960 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
UFM1P61960 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
UFM1P61960 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
UFM1P61960 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
UFM1P61960 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
UFM1P61960 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
UFM1P61960 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
UFM1P61960 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
UFM1P61960 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
UFM1P61960 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms