Protein–RNA interactions for Protein: P60900

PSMA6, Proteasome subunit alpha type-6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMA6P60900 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PSMA6P60900 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PSMA6P60900 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PSMA6P60900 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PSMA6P60900 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PSMA6P60900 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PSMA6P60900 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PSMA6P60900 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PSMA6P60900 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PSMA6P60900 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PSMA6P60900 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PSMA6P60900 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PSMA6P60900 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PSMA6P60900 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PSMA6P60900 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
PSMA6P60900 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
PSMA6P60900 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PSMA6P60900 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PSMA6P60900 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PSMA6P60900 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
PSMA6P60900 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
PSMA6P60900 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
PSMA6P60900 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
PSMA6P60900 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMA6P60900 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMA6P60900 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMA6P60900 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMA6P60900 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMA6P60900 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMA6P60900 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMA6P60900 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMA6P60900 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMA6P60900 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMA6P60900 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMA6P60900 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMA6P60900 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMA6P60900 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMA6P60900 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMA6P60900 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMA6P60900 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMA6P60900 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMA6P60900 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMA6P60900 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMA6P60900 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMA6P60900 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMA6P60900 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMA6P60900 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMA6P60900 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMA6P60900 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMA6P60900 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMA6P60900 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMA6P60900 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMA6P60900 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMA6P60900 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMA6P60900 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMA6P60900 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMA6P60900 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMA6P60900 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMA6P60900 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMA6P60900 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMA6P60900 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMA6P60900 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMA6P60900 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMA6P60900 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMA6P60900 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMA6P60900 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMA6P60900 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMA6P60900 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMA6P60900 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMA6P60900 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMA6P60900 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMA6P60900 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMA6P60900 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMA6P60900 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMA6P60900 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMA6P60900 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMA6P60900 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMA6P60900 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMA6P60900 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMA6P60900 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMA6P60900 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMA6P60900 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMA6P60900 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMA6P60900 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMA6P60900 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMA6P60900 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMA6P60900 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMA6P60900 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMA6P60900 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMA6P60900 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMA6P60900 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMA6P60900 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMA6P60900 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMA6P60900 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMA6P60900 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMA6P60900 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMA6P60900 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMA6P60900 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMA6P60900 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMA6P60900 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms