Protein–RNA interactions for Protein: P51157

RAB28, Ras-related protein Rab-28, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB28P51157 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAB28P51157 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAB28P51157 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAB28P51157 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAB28P51157 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAB28P51157 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAB28P51157 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAB28P51157 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAB28P51157 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAB28P51157 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
RAB28P51157 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAB28P51157 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAB28P51157 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAB28P51157 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAB28P51157 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAB28P51157 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAB28P51157 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAB28P51157 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAB28P51157 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RAB28P51157 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RAB28P51157 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RAB28P51157 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RAB28P51157 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RAB28P51157 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RAB28P51157 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RAB28P51157 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RAB28P51157 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RAB28P51157 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RAB28P51157 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RAB28P51157 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RAB28P51157 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RAB28P51157 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RAB28P51157 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RAB28P51157 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RAB28P51157 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RAB28P51157 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RAB28P51157 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RAB28P51157 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
RAB28P51157 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RAB28P51157 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RAB28P51157 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RAB28P51157 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RAB28P51157 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
RAB28P51157 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RAB28P51157 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RAB28P51157 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RAB28P51157 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
RAB28P51157 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RAB28P51157 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RAB28P51157 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RAB28P51157 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RAB28P51157 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RAB28P51157 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RAB28P51157 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RAB28P51157 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RAB28P51157 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RAB28P51157 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RAB28P51157 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RAB28P51157 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RAB28P51157 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RAB28P51157 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RAB28P51157 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RAB28P51157 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RAB28P51157 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RAB28P51157 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RAB28P51157 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RAB28P51157 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RAB28P51157 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RAB28P51157 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RAB28P51157 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RAB28P51157 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RAB28P51157 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RAB28P51157 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RAB28P51157 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RAB28P51157 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RAB28P51157 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RAB28P51157 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RAB28P51157 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
RAB28P51157 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RAB28P51157 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
RAB28P51157 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RAB28P51157 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RAB28P51157 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RAB28P51157 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RAB28P51157 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RAB28P51157 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RAB28P51157 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RAB28P51157 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RAB28P51157 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RAB28P51157 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RAB28P51157 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
RAB28P51157 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RAB28P51157 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RAB28P51157 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RAB28P51157 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RAB28P51157 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RAB28P51157 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RAB28P51157 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
RAB28P51157 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RAB28P51157 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms