Protein–RNA interactions for Protein: P48739

PITPNB, Phosphatidylinositol transfer protein beta isoform, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITPNBP48739 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PITPNBP48739 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PITPNBP48739 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PITPNBP48739 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PITPNBP48739 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
PITPNBP48739 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PITPNBP48739 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PITPNBP48739 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PITPNBP48739 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PITPNBP48739 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PITPNBP48739 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PITPNBP48739 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PITPNBP48739 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PITPNBP48739 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PITPNBP48739 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PITPNBP48739 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PITPNBP48739 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PITPNBP48739 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PITPNBP48739 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PITPNBP48739 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PITPNBP48739 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PITPNBP48739 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PITPNBP48739 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PITPNBP48739 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PITPNBP48739 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PITPNBP48739 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PITPNBP48739 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PITPNBP48739 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PITPNBP48739 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PITPNBP48739 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PITPNBP48739 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PITPNBP48739 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PITPNBP48739 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PITPNBP48739 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PITPNBP48739 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PITPNBP48739 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PITPNBP48739 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PITPNBP48739 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PITPNBP48739 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PITPNBP48739 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PITPNBP48739 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PITPNBP48739 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PITPNBP48739 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PITPNBP48739 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PITPNBP48739 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PITPNBP48739 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PITPNBP48739 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PITPNBP48739 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PITPNBP48739 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PITPNBP48739 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PITPNBP48739 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PITPNBP48739 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PITPNBP48739 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PITPNBP48739 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PITPNBP48739 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PITPNBP48739 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PITPNBP48739 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PITPNBP48739 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PITPNBP48739 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PITPNBP48739 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PITPNBP48739 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PITPNBP48739 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PITPNBP48739 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PITPNBP48739 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PITPNBP48739 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PITPNBP48739 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PITPNBP48739 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PITPNBP48739 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PITPNBP48739 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PITPNBP48739 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PITPNBP48739 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PITPNBP48739 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PITPNBP48739 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PITPNBP48739 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PITPNBP48739 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PITPNBP48739 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PITPNBP48739 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PITPNBP48739 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PITPNBP48739 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PITPNBP48739 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PITPNBP48739 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PITPNBP48739 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PITPNBP48739 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PITPNBP48739 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PITPNBP48739 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PITPNBP48739 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PITPNBP48739 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PITPNBP48739 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PITPNBP48739 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PITPNBP48739 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PITPNBP48739 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PITPNBP48739 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PITPNBP48739 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PITPNBP48739 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PITPNBP48739 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PITPNBP48739 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PITPNBP48739 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PITPNBP48739 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PITPNBP48739 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PITPNBP48739 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms