Protein–RNA interactions for Protein: P36954

POLR2I, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2IP36954 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
POLR2IP36954 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC16■□□□□ 0.15
POLR2IP36954 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
POLR2IP36954 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
POLR2IP36954 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC16■□□□□ 0.15
POLR2IP36954 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
POLR2IP36954 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
POLR2IP36954 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
POLR2IP36954 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
POLR2IP36954 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
POLR2IP36954 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
POLR2IP36954 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
POLR2IP36954 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC16■□□□□ 0.15
POLR2IP36954 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC16■□□□□ 0.15
POLR2IP36954 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC16■□□□□ 0.15
POLR2IP36954 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
POLR2IP36954 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
POLR2IP36954 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
POLR2IP36954 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC16■□□□□ 0.15
POLR2IP36954 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
POLR2IP36954 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
POLR2IP36954 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
POLR2IP36954 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
POLR2IP36954 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
POLR2IP36954 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
POLR2IP36954 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
POLR2IP36954 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
POLR2IP36954 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
POLR2IP36954 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
POLR2IP36954 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
POLR2IP36954 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
POLR2IP36954 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
POLR2IP36954 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
POLR2IP36954 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
POLR2IP36954 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
POLR2IP36954 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
POLR2IP36954 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
POLR2IP36954 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
POLR2IP36954 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
POLR2IP36954 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
POLR2IP36954 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
POLR2IP36954 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
POLR2IP36954 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
POLR2IP36954 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
POLR2IP36954 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
POLR2IP36954 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
POLR2IP36954 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
POLR2IP36954 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
POLR2IP36954 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
POLR2IP36954 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
POLR2IP36954 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
POLR2IP36954 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
POLR2IP36954 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
POLR2IP36954 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
POLR2IP36954 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
POLR2IP36954 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
POLR2IP36954 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
POLR2IP36954 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
POLR2IP36954 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
POLR2IP36954 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
POLR2IP36954 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
POLR2IP36954 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
POLR2IP36954 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
POLR2IP36954 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
POLR2IP36954 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
POLR2IP36954 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
POLR2IP36954 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
POLR2IP36954 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
POLR2IP36954 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
POLR2IP36954 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
POLR2IP36954 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
POLR2IP36954 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
POLR2IP36954 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
POLR2IP36954 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
POLR2IP36954 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
POLR2IP36954 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
POLR2IP36954 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
POLR2IP36954 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
POLR2IP36954 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
POLR2IP36954 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
POLR2IP36954 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
POLR2IP36954 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
POLR2IP36954 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
POLR2IP36954 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
POLR2IP36954 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
POLR2IP36954 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
POLR2IP36954 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
POLR2IP36954 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
POLR2IP36954 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
POLR2IP36954 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
POLR2IP36954 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
POLR2IP36954 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
POLR2IP36954 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
POLR2IP36954 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
POLR2IP36954 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
POLR2IP36954 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
POLR2IP36954 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
POLR2IP36954 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
POLR2IP36954 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
POLR2IP36954 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.4 ms