Protein–RNA interactions for Protein: P36543

ATP6V1E1, V-type proton ATPase subunit E 1, humanhuman

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6V1E1P36543 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP6V1E1P36543 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP6V1E1P36543 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP6V1E1P36543 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP6V1E1P36543 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP6V1E1P36543 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP6V1E1P36543 ST6GAL2-204ENST00000409382 7275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP6V1E1P36543 CCDC88A-201ENST00000263630 9667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP6V1E1P36543 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP6V1E1P36543 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP6V1E1P36543 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP6V1E1P36543 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP6V1E1P36543 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP6V1E1P36543 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP6V1E1P36543 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP6V1E1P36543 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP6V1E1P36543 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP6V1E1P36543 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP6V1E1P36543 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP6V1E1P36543 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP6V1E1P36543 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP6V1E1P36543 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP6V1E1P36543 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP6V1E1P36543 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP6V1E1P36543 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP6V1E1P36543 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP6V1E1P36543 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP6V1E1P36543 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP6V1E1P36543 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP6V1E1P36543 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP6V1E1P36543 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP6V1E1P36543 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP6V1E1P36543 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP6V1E1P36543 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP6V1E1P36543 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP6V1E1P36543 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP6V1E1P36543 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP6V1E1P36543 IL17RA-201ENST00000319363 8607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP6V1E1P36543 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP6V1E1P36543 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP6V1E1P36543 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP6V1E1P36543 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ATP6V1E1P36543 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ATP6V1E1P36543 KHNYN-201ENST00000251343 6725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ATP6V1E1P36543 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ATP6V1E1P36543 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
ATP6V1E1P36543 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
ATP6V1E1P36543 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ATP6V1E1P36543 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
ATP6V1E1P36543 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ATP6V1E1P36543 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.13
ATP6V1E1P36543 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
ATP6V1E1P36543 KMT2E-202ENST00000311117 6874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ATP6V1E1P36543 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ATP6V1E1P36543 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ATP6V1E1P36543 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATP6V1E1P36543 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATP6V1E1P36543 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATP6V1E1P36543 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATP6V1E1P36543 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATP6V1E1P36543 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATP6V1E1P36543 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATP6V1E1P36543 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATP6V1E1P36543 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATP6V1E1P36543 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATP6V1E1P36543 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATP6V1E1P36543 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATP6V1E1P36543 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATP6V1E1P36543 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATP6V1E1P36543 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
ATP6V1E1P36543 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
ATP6V1E1P36543 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATP6V1E1P36543 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATP6V1E1P36543 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATP6V1E1P36543 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATP6V1E1P36543 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATP6V1E1P36543 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATP6V1E1P36543 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATP6V1E1P36543 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATP6V1E1P36543 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATP6V1E1P36543 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATP6V1E1P36543 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATP6V1E1P36543 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATP6V1E1P36543 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATP6V1E1P36543 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATP6V1E1P36543 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATP6V1E1P36543 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
ATP6V1E1P36543 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATP6V1E1P36543 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATP6V1E1P36543 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATP6V1E1P36543 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATP6V1E1P36543 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATP6V1E1P36543 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATP6V1E1P36543 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATP6V1E1P36543 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATP6V1E1P36543 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATP6V1E1P36543 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATP6V1E1P36543 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATP6V1E1P36543 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATP6V1E1P36543 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms