Protein–RNA interactions for Protein: P29965

CD40LG, CD40 ligand, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD40LGP29965 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD40LGP29965 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD40LGP29965 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD40LGP29965 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD40LGP29965 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD40LGP29965 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD40LGP29965 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD40LGP29965 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD40LGP29965 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD40LGP29965 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD40LGP29965 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD40LGP29965 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD40LGP29965 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD40LGP29965 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD40LGP29965 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD40LGP29965 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD40LGP29965 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD40LGP29965 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD40LGP29965 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD40LGP29965 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD40LGP29965 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD40LGP29965 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD40LGP29965 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CD40LGP29965 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD40LGP29965 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD40LGP29965 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD40LGP29965 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD40LGP29965 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD40LGP29965 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CD40LGP29965 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD40LGP29965 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CD40LGP29965 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CD40LGP29965 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD40LGP29965 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD40LGP29965 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD40LGP29965 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD40LGP29965 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD40LGP29965 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD40LGP29965 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD40LGP29965 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD40LGP29965 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD40LGP29965 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD40LGP29965 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD40LGP29965 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD40LGP29965 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD40LGP29965 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CD40LGP29965 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD40LGP29965 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD40LGP29965 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD40LGP29965 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD40LGP29965 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD40LGP29965 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD40LGP29965 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD40LGP29965 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD40LGP29965 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD40LGP29965 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD40LGP29965 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD40LGP29965 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD40LGP29965 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD40LGP29965 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD40LGP29965 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD40LGP29965 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD40LGP29965 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD40LGP29965 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD40LGP29965 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD40LGP29965 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD40LGP29965 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD40LGP29965 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD40LGP29965 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD40LGP29965 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD40LGP29965 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD40LGP29965 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD40LGP29965 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD40LGP29965 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD40LGP29965 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD40LGP29965 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD40LGP29965 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD40LGP29965 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD40LGP29965 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD40LGP29965 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD40LGP29965 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD40LGP29965 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD40LGP29965 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD40LGP29965 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD40LGP29965 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CD40LGP29965 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD40LGP29965 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD40LGP29965 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CD40LGP29965 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CD40LGP29965 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD40LGP29965 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD40LGP29965 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD40LGP29965 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD40LGP29965 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD40LGP29965 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD40LGP29965 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD40LGP29965 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD40LGP29965 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD40LGP29965 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD40LGP29965 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms