Protein–RNA interactions for Protein: P28065

PSMB9, Proteasome subunit beta type-9, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB9P28065 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PSMB9P28065 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PSMB9P28065 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PSMB9P28065 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PSMB9P28065 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PSMB9P28065 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PSMB9P28065 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PSMB9P28065 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PSMB9P28065 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PSMB9P28065 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PSMB9P28065 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PSMB9P28065 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PSMB9P28065 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PSMB9P28065 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PSMB9P28065 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PSMB9P28065 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PSMB9P28065 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PSMB9P28065 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PSMB9P28065 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PSMB9P28065 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PSMB9P28065 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PSMB9P28065 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PSMB9P28065 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PSMB9P28065 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PSMB9P28065 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PSMB9P28065 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PSMB9P28065 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PSMB9P28065 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PSMB9P28065 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PSMB9P28065 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PSMB9P28065 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PSMB9P28065 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PSMB9P28065 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PSMB9P28065 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PSMB9P28065 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PSMB9P28065 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PSMB9P28065 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PSMB9P28065 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PSMB9P28065 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PSMB9P28065 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PSMB9P28065 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
PSMB9P28065 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PSMB9P28065 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PSMB9P28065 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PSMB9P28065 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PSMB9P28065 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PSMB9P28065 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PSMB9P28065 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PSMB9P28065 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PSMB9P28065 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
PSMB9P28065 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
PSMB9P28065 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PSMB9P28065 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PSMB9P28065 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PSMB9P28065 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PSMB9P28065 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PSMB9P28065 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PSMB9P28065 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PSMB9P28065 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PSMB9P28065 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PSMB9P28065 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PSMB9P28065 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PSMB9P28065 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PSMB9P28065 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PSMB9P28065 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PSMB9P28065 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PSMB9P28065 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PSMB9P28065 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PSMB9P28065 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PSMB9P28065 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PSMB9P28065 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PSMB9P28065 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PSMB9P28065 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PSMB9P28065 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PSMB9P28065 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PSMB9P28065 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PSMB9P28065 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PSMB9P28065 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PSMB9P28065 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PSMB9P28065 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PSMB9P28065 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PSMB9P28065 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PSMB9P28065 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PSMB9P28065 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PSMB9P28065 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PSMB9P28065 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PSMB9P28065 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PSMB9P28065 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PSMB9P28065 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PSMB9P28065 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PSMB9P28065 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PSMB9P28065 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PSMB9P28065 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PSMB9P28065 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PSMB9P28065 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PSMB9P28065 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PSMB9P28065 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PSMB9P28065 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PSMB9P28065 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PSMB9P28065 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.1 ms