Protein–RNA interactions for Protein: P25788

PSMA3, Proteasome subunit alpha type-3, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMA3P25788 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PSMA3P25788 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PSMA3P25788 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PSMA3P25788 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PSMA3P25788 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PSMA3P25788 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PSMA3P25788 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PSMA3P25788 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PSMA3P25788 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PSMA3P25788 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
PSMA3P25788 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PSMA3P25788 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PSMA3P25788 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PSMA3P25788 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PSMA3P25788 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PSMA3P25788 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PSMA3P25788 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PSMA3P25788 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PSMA3P25788 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PSMA3P25788 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PSMA3P25788 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PSMA3P25788 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PSMA3P25788 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PSMA3P25788 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PSMA3P25788 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PSMA3P25788 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PSMA3P25788 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
PSMA3P25788 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PSMA3P25788 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
PSMA3P25788 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PSMA3P25788 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PSMA3P25788 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PSMA3P25788 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PSMA3P25788 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PSMA3P25788 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PSMA3P25788 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PSMA3P25788 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PSMA3P25788 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PSMA3P25788 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PSMA3P25788 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PSMA3P25788 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PSMA3P25788 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PSMA3P25788 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PSMA3P25788 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
PSMA3P25788 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
PSMA3P25788 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PSMA3P25788 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PSMA3P25788 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PSMA3P25788 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PSMA3P25788 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PSMA3P25788 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PSMA3P25788 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PSMA3P25788 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PSMA3P25788 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PSMA3P25788 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PSMA3P25788 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PSMA3P25788 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PSMA3P25788 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PSMA3P25788 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PSMA3P25788 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
PSMA3P25788 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PSMA3P25788 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PSMA3P25788 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PSMA3P25788 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PSMA3P25788 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PSMA3P25788 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PSMA3P25788 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PSMA3P25788 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PSMA3P25788 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PSMA3P25788 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PSMA3P25788 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PSMA3P25788 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PSMA3P25788 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PSMA3P25788 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PSMA3P25788 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PSMA3P25788 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PSMA3P25788 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PSMA3P25788 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PSMA3P25788 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PSMA3P25788 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PSMA3P25788 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PSMA3P25788 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PSMA3P25788 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PSMA3P25788 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PSMA3P25788 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PSMA3P25788 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
PSMA3P25788 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PSMA3P25788 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PSMA3P25788 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PSMA3P25788 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PSMA3P25788 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PSMA3P25788 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PSMA3P25788 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PSMA3P25788 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PSMA3P25788 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PSMA3P25788 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PSMA3P25788 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PSMA3P25788 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PSMA3P25788 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PSMA3P25788 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.6 ms