Protein–RNA interactions for Protein: P25786

PSMA1, Proteasome subunit alpha type-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 263 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMA1P25786 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSMA1P25786 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSMA1P25786 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSMA1P25786 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSMA1P25786 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSMA1P25786 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSMA1P25786 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSMA1P25786 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSMA1P25786 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSMA1P25786 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSMA1P25786 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSMA1P25786 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSMA1P25786 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSMA1P25786 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PSMA1P25786 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSMA1P25786 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSMA1P25786 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMA1P25786 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMA1P25786 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMA1P25786 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMA1P25786 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMA1P25786 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMA1P25786 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMA1P25786 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMA1P25786 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMA1P25786 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMA1P25786 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMA1P25786 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMA1P25786 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMA1P25786 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMA1P25786 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMA1P25786 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMA1P25786 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMA1P25786 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMA1P25786 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMA1P25786 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMA1P25786 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMA1P25786 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMA1P25786 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMA1P25786 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMA1P25786 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMA1P25786 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMA1P25786 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMA1P25786 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMA1P25786 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMA1P25786 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMA1P25786 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMA1P25786 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMA1P25786 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMA1P25786 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMA1P25786 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMA1P25786 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMA1P25786 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMA1P25786 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMA1P25786 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMA1P25786 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMA1P25786 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMA1P25786 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMA1P25786 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMA1P25786 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMA1P25786 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PSMA1P25786 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PSMA1P25786 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PSMA1P25786 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PSMA1P25786 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PSMA1P25786 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PSMA1P25786 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PSMA1P25786 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PSMA1P25786 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PSMA1P25786 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PSMA1P25786 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PSMA1P25786 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PSMA1P25786 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PSMA1P25786 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PSMA1P25786 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PSMA1P25786 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PSMA1P25786 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PSMA1P25786 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PSMA1P25786 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PSMA1P25786 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PSMA1P25786 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PSMA1P25786 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PSMA1P25786 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PSMA1P25786 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PSMA1P25786 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PSMA1P25786 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PSMA1P25786 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PSMA1P25786 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PSMA1P25786 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PSMA1P25786 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PSMA1P25786 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PSMA1P25786 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PSMA1P25786 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PSMA1P25786 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PSMA1P25786 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PSMA1P25786 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PSMA1P25786 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PSMA1P25786 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PSMA1P25786 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PSMA1P25786 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms