Protein–RNA interactions for Protein: P24390

KDELR1, ER lumen protein-retaining receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDELR1P24390 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KDELR1P24390 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KDELR1P24390 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KDELR1P24390 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KDELR1P24390 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KDELR1P24390 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KDELR1P24390 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KDELR1P24390 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KDELR1P24390 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KDELR1P24390 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KDELR1P24390 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KDELR1P24390 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KDELR1P24390 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KDELR1P24390 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KDELR1P24390 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KDELR1P24390 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KDELR1P24390 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KDELR1P24390 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KDELR1P24390 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KDELR1P24390 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KDELR1P24390 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KDELR1P24390 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KDELR1P24390 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KDELR1P24390 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KDELR1P24390 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KDELR1P24390 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KDELR1P24390 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
KDELR1P24390 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KDELR1P24390 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KDELR1P24390 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KDELR1P24390 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
KDELR1P24390 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KDELR1P24390 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KDELR1P24390 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KDELR1P24390 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KDELR1P24390 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KDELR1P24390 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KDELR1P24390 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KDELR1P24390 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KDELR1P24390 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KDELR1P24390 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KDELR1P24390 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KDELR1P24390 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KDELR1P24390 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
KDELR1P24390 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
KDELR1P24390 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KDELR1P24390 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KDELR1P24390 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KDELR1P24390 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KDELR1P24390 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KDELR1P24390 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
KDELR1P24390 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
KDELR1P24390 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KDELR1P24390 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KDELR1P24390 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KDELR1P24390 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
KDELR1P24390 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KDELR1P24390 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
KDELR1P24390 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
KDELR1P24390 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
KDELR1P24390 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
KDELR1P24390 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KDELR1P24390 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KDELR1P24390 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
KDELR1P24390 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
KDELR1P24390 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
KDELR1P24390 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
KDELR1P24390 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
KDELR1P24390 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
KDELR1P24390 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KDELR1P24390 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KDELR1P24390 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
KDELR1P24390 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KDELR1P24390 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
KDELR1P24390 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
KDELR1P24390 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
KDELR1P24390 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
KDELR1P24390 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
KDELR1P24390 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
KDELR1P24390 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
KDELR1P24390 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
KDELR1P24390 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
KDELR1P24390 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
KDELR1P24390 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
KDELR1P24390 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
KDELR1P24390 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
KDELR1P24390 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
KDELR1P24390 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
KDELR1P24390 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
KDELR1P24390 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
KDELR1P24390 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
KDELR1P24390 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
KDELR1P24390 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
KDELR1P24390 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
KDELR1P24390 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
KDELR1P24390 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
KDELR1P24390 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
KDELR1P24390 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
KDELR1P24390 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
KDELR1P24390 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms