Protein–RNA interactions for Protein: P16220

CREB1, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB1P16220 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CREB1P16220 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CREB1P16220 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CREB1P16220 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CREB1P16220 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CREB1P16220 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CREB1P16220 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
CREB1P16220 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CREB1P16220 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CREB1P16220 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CREB1P16220 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CREB1P16220 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CREB1P16220 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CREB1P16220 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CREB1P16220 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.38
CREB1P16220 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CREB1P16220 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CREB1P16220 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CREB1P16220 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CREB1P16220 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CREB1P16220 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CREB1P16220 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CREB1P16220 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CREB1P16220 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CREB1P16220 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CREB1P16220 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CREB1P16220 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CREB1P16220 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CREB1P16220 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CREB1P16220 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CREB1P16220 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CREB1P16220 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CREB1P16220 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CREB1P16220 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CREB1P16220 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CREB1P16220 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CREB1P16220 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CREB1P16220 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CREB1P16220 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CREB1P16220 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CREB1P16220 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CREB1P16220 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CREB1P16220 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CREB1P16220 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CREB1P16220 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CREB1P16220 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CREB1P16220 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CREB1P16220 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CREB1P16220 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CREB1P16220 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CREB1P16220 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CREB1P16220 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CREB1P16220 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CREB1P16220 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CREB1P16220 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CREB1P16220 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CREB1P16220 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CREB1P16220 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CREB1P16220 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CREB1P16220 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CREB1P16220 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CREB1P16220 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CREB1P16220 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CREB1P16220 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CREB1P16220 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CREB1P16220 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CREB1P16220 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CREB1P16220 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CREB1P16220 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CREB1P16220 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CREB1P16220 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CREB1P16220 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CREB1P16220 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CREB1P16220 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CREB1P16220 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CREB1P16220 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CREB1P16220 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CREB1P16220 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CREB1P16220 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CREB1P16220 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CREB1P16220 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CREB1P16220 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CREB1P16220 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CREB1P16220 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CREB1P16220 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CREB1P16220 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CREB1P16220 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CREB1P16220 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CREB1P16220 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CREB1P16220 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CREB1P16220 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CREB1P16220 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CREB1P16220 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CREB1P16220 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CREB1P16220 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CREB1P16220 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CREB1P16220 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CREB1P16220 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CREB1P16220 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CREB1P16220 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms