Protein–RNA interactions for Protein: P0C2W7

CT47B1, Cancer/testis antigen 47B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CT47B1P0C2W7 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CT47B1P0C2W7 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CT47B1P0C2W7 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CT47B1P0C2W7 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CT47B1P0C2W7 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CT47B1P0C2W7 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CT47B1P0C2W7 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CT47B1P0C2W7 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CT47B1P0C2W7 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CT47B1P0C2W7 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CT47B1P0C2W7 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CT47B1P0C2W7 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CT47B1P0C2W7 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CT47B1P0C2W7 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CT47B1P0C2W7 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CT47B1P0C2W7 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CT47B1P0C2W7 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CT47B1P0C2W7 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CT47B1P0C2W7 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CT47B1P0C2W7 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CT47B1P0C2W7 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CT47B1P0C2W7 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CT47B1P0C2W7 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CT47B1P0C2W7 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CT47B1P0C2W7 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CT47B1P0C2W7 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CT47B1P0C2W7 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CT47B1P0C2W7 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CT47B1P0C2W7 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CT47B1P0C2W7 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CT47B1P0C2W7 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CT47B1P0C2W7 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CT47B1P0C2W7 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CT47B1P0C2W7 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CT47B1P0C2W7 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CT47B1P0C2W7 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CT47B1P0C2W7 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CT47B1P0C2W7 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CT47B1P0C2W7 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CT47B1P0C2W7 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CT47B1P0C2W7 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CT47B1P0C2W7 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CT47B1P0C2W7 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CT47B1P0C2W7 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CT47B1P0C2W7 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CT47B1P0C2W7 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CT47B1P0C2W7 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CT47B1P0C2W7 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CT47B1P0C2W7 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CT47B1P0C2W7 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CT47B1P0C2W7 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CT47B1P0C2W7 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CT47B1P0C2W7 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CT47B1P0C2W7 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
CT47B1P0C2W7 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CT47B1P0C2W7 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CT47B1P0C2W7 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CT47B1P0C2W7 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CT47B1P0C2W7 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CT47B1P0C2W7 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CT47B1P0C2W7 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CT47B1P0C2W7 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CT47B1P0C2W7 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CT47B1P0C2W7 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CT47B1P0C2W7 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CT47B1P0C2W7 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CT47B1P0C2W7 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CT47B1P0C2W7 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CT47B1P0C2W7 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CT47B1P0C2W7 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CT47B1P0C2W7 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CT47B1P0C2W7 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CT47B1P0C2W7 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CT47B1P0C2W7 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CT47B1P0C2W7 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CT47B1P0C2W7 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CT47B1P0C2W7 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CT47B1P0C2W7 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CT47B1P0C2W7 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CT47B1P0C2W7 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CT47B1P0C2W7 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CT47B1P0C2W7 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CT47B1P0C2W7 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CT47B1P0C2W7 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CT47B1P0C2W7 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CT47B1P0C2W7 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CT47B1P0C2W7 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CT47B1P0C2W7 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CT47B1P0C2W7 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CT47B1P0C2W7 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CT47B1P0C2W7 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CT47B1P0C2W7 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CT47B1P0C2W7 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CT47B1P0C2W7 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CT47B1P0C2W7 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CT47B1P0C2W7 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CT47B1P0C2W7 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CT47B1P0C2W7 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CT47B1P0C2W7 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CT47B1P0C2W7 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms