Protein–RNA interactions for Protein: P01854

IGHE, Immunoglobulin heavy constant epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHEP01854 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IGHEP01854 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
IGHEP01854 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
IGHEP01854 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
IGHEP01854 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
IGHEP01854 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
IGHEP01854 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
IGHEP01854 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
IGHEP01854 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IGHEP01854 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IGHEP01854 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IGHEP01854 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IGHEP01854 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IGHEP01854 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IGHEP01854 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IGHEP01854 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IGHEP01854 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IGHEP01854 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IGHEP01854 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IGHEP01854 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IGHEP01854 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IGHEP01854 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IGHEP01854 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IGHEP01854 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IGHEP01854 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IGHEP01854 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IGHEP01854 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IGHEP01854 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IGHEP01854 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IGHEP01854 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IGHEP01854 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IGHEP01854 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IGHEP01854 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IGHEP01854 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IGHEP01854 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IGHEP01854 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IGHEP01854 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IGHEP01854 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IGHEP01854 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IGHEP01854 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IGHEP01854 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IGHEP01854 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IGHEP01854 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IGHEP01854 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IGHEP01854 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IGHEP01854 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
IGHEP01854 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IGHEP01854 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
IGHEP01854 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
IGHEP01854 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IGHEP01854 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IGHEP01854 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IGHEP01854 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IGHEP01854 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IGHEP01854 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IGHEP01854 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
IGHEP01854 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IGHEP01854 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
IGHEP01854 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IGHEP01854 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IGHEP01854 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IGHEP01854 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IGHEP01854 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IGHEP01854 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IGHEP01854 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IGHEP01854 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IGHEP01854 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IGHEP01854 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IGHEP01854 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IGHEP01854 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IGHEP01854 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IGHEP01854 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IGHEP01854 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IGHEP01854 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IGHEP01854 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IGHEP01854 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IGHEP01854 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IGHEP01854 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
IGHEP01854 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
IGHEP01854 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IGHEP01854 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IGHEP01854 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IGHEP01854 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
IGHEP01854 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IGHEP01854 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
IGHEP01854 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
IGHEP01854 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IGHEP01854 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
IGHEP01854 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IGHEP01854 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
IGHEP01854 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IGHEP01854 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
IGHEP01854 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IGHEP01854 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
IGHEP01854 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
IGHEP01854 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
IGHEP01854 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
IGHEP01854 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
IGHEP01854 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
IGHEP01854 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms