Protein–RNA interactions for Protein: O75879

GATB, Glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit B, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATBO75879 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GATBO75879 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GATBO75879 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GATBO75879 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GATBO75879 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GATBO75879 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GATBO75879 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GATBO75879 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GATBO75879 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GATBO75879 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GATBO75879 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GATBO75879 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
GATBO75879 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GATBO75879 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GATBO75879 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GATBO75879 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GATBO75879 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GATBO75879 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GATBO75879 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GATBO75879 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GATBO75879 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
GATBO75879 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GATBO75879 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GATBO75879 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GATBO75879 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GATBO75879 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GATBO75879 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
GATBO75879 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GATBO75879 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GATBO75879 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GATBO75879 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GATBO75879 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GATBO75879 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GATBO75879 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GATBO75879 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GATBO75879 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GATBO75879 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GATBO75879 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GATBO75879 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GATBO75879 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GATBO75879 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GATBO75879 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GATBO75879 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GATBO75879 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GATBO75879 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GATBO75879 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GATBO75879 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GATBO75879 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
GATBO75879 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
GATBO75879 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
GATBO75879 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
GATBO75879 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
GATBO75879 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
GATBO75879 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
GATBO75879 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
GATBO75879 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GATBO75879 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GATBO75879 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GATBO75879 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GATBO75879 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GATBO75879 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GATBO75879 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GATBO75879 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GATBO75879 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
GATBO75879 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GATBO75879 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GATBO75879 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GATBO75879 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GATBO75879 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GATBO75879 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GATBO75879 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GATBO75879 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GATBO75879 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GATBO75879 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GATBO75879 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GATBO75879 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GATBO75879 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GATBO75879 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GATBO75879 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GATBO75879 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GATBO75879 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GATBO75879 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GATBO75879 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GATBO75879 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GATBO75879 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GATBO75879 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
GATBO75879 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GATBO75879 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GATBO75879 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GATBO75879 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GATBO75879 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GATBO75879 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GATBO75879 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GATBO75879 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GATBO75879 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GATBO75879 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GATBO75879 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GATBO75879 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GATBO75879 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GATBO75879 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms