Protein–RNA interactions for Protein: O75323

NIPSNAP2, Protein NipSnap homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP2O75323 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NIPSNAP2O75323 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NIPSNAP2O75323 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
NIPSNAP2O75323 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NIPSNAP2O75323 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
NIPSNAP2O75323 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NIPSNAP2O75323 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NIPSNAP2O75323 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NIPSNAP2O75323 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NIPSNAP2O75323 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NIPSNAP2O75323 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NIPSNAP2O75323 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NIPSNAP2O75323 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NIPSNAP2O75323 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NIPSNAP2O75323 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NIPSNAP2O75323 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NIPSNAP2O75323 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NIPSNAP2O75323 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NIPSNAP2O75323 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NIPSNAP2O75323 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NIPSNAP2O75323 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NIPSNAP2O75323 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NIPSNAP2O75323 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NIPSNAP2O75323 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NIPSNAP2O75323 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
NIPSNAP2O75323 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NIPSNAP2O75323 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NIPSNAP2O75323 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NIPSNAP2O75323 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NIPSNAP2O75323 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NIPSNAP2O75323 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NIPSNAP2O75323 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NIPSNAP2O75323 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
NIPSNAP2O75323 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NIPSNAP2O75323 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NIPSNAP2O75323 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NIPSNAP2O75323 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NIPSNAP2O75323 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
NIPSNAP2O75323 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NIPSNAP2O75323 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NIPSNAP2O75323 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NIPSNAP2O75323 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NIPSNAP2O75323 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NIPSNAP2O75323 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NIPSNAP2O75323 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NIPSNAP2O75323 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NIPSNAP2O75323 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NIPSNAP2O75323 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NIPSNAP2O75323 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NIPSNAP2O75323 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NIPSNAP2O75323 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
NIPSNAP2O75323 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
NIPSNAP2O75323 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
NIPSNAP2O75323 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
NIPSNAP2O75323 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NIPSNAP2O75323 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NIPSNAP2O75323 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NIPSNAP2O75323 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NIPSNAP2O75323 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NIPSNAP2O75323 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NIPSNAP2O75323 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NIPSNAP2O75323 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NIPSNAP2O75323 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NIPSNAP2O75323 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NIPSNAP2O75323 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NIPSNAP2O75323 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NIPSNAP2O75323 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NIPSNAP2O75323 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
NIPSNAP2O75323 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NIPSNAP2O75323 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
NIPSNAP2O75323 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NIPSNAP2O75323 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NIPSNAP2O75323 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NIPSNAP2O75323 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NIPSNAP2O75323 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NIPSNAP2O75323 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NIPSNAP2O75323 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NIPSNAP2O75323 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NIPSNAP2O75323 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NIPSNAP2O75323 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NIPSNAP2O75323 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NIPSNAP2O75323 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NIPSNAP2O75323 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NIPSNAP2O75323 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NIPSNAP2O75323 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NIPSNAP2O75323 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NIPSNAP2O75323 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NIPSNAP2O75323 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NIPSNAP2O75323 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NIPSNAP2O75323 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NIPSNAP2O75323 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NIPSNAP2O75323 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NIPSNAP2O75323 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NIPSNAP2O75323 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NIPSNAP2O75323 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NIPSNAP2O75323 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NIPSNAP2O75323 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NIPSNAP2O75323 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NIPSNAP2O75323 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NIPSNAP2O75323 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.2 ms