Protein–RNA interactions for Protein: O43255

SIAH2, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH2, humanhuman

Predictions only

Length 324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIAH2O43255 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SIAH2O43255 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SIAH2O43255 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SIAH2O43255 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SIAH2O43255 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SIAH2O43255 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
SIAH2O43255 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SIAH2O43255 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SIAH2O43255 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SIAH2O43255 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SIAH2O43255 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SIAH2O43255 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SIAH2O43255 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SIAH2O43255 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SIAH2O43255 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SIAH2O43255 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SIAH2O43255 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SIAH2O43255 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SIAH2O43255 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SIAH2O43255 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SIAH2O43255 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SIAH2O43255 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SIAH2O43255 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SIAH2O43255 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SIAH2O43255 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SIAH2O43255 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SIAH2O43255 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
SIAH2O43255 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SIAH2O43255 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SIAH2O43255 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SIAH2O43255 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SIAH2O43255 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SIAH2O43255 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SIAH2O43255 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SIAH2O43255 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SIAH2O43255 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SIAH2O43255 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SIAH2O43255 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SIAH2O43255 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SIAH2O43255 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SIAH2O43255 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SIAH2O43255 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SIAH2O43255 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SIAH2O43255 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SIAH2O43255 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SIAH2O43255 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SIAH2O43255 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SIAH2O43255 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SIAH2O43255 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SIAH2O43255 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SIAH2O43255 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SIAH2O43255 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SIAH2O43255 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SIAH2O43255 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SIAH2O43255 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SIAH2O43255 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SIAH2O43255 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
SIAH2O43255 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
SIAH2O43255 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SIAH2O43255 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SIAH2O43255 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SIAH2O43255 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
SIAH2O43255 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
SIAH2O43255 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SIAH2O43255 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SIAH2O43255 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SIAH2O43255 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SIAH2O43255 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
SIAH2O43255 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SIAH2O43255 USP3-AS1-204ENST00000559861 620 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SIAH2O43255 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
SIAH2O43255 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SIAH2O43255 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SIAH2O43255 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SIAH2O43255 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SIAH2O43255 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SIAH2O43255 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SIAH2O43255 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SIAH2O43255 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SIAH2O43255 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SIAH2O43255 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SIAH2O43255 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SIAH2O43255 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SIAH2O43255 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SIAH2O43255 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SIAH2O43255 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SIAH2O43255 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SIAH2O43255 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SIAH2O43255 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SIAH2O43255 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SIAH2O43255 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SIAH2O43255 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SIAH2O43255 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SIAH2O43255 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SIAH2O43255 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SIAH2O43255 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SIAH2O43255 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SIAH2O43255 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SIAH2O43255 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SIAH2O43255 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 152.9 ms