Protein–RNA interactions for Protein: O14503

BHLHE40, Class E basic helix-loop-helix protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE40O14503 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
BHLHE40O14503 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
BHLHE40O14503 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
BHLHE40O14503 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
BHLHE40O14503 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
BHLHE40O14503 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
BHLHE40O14503 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
BHLHE40O14503 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
BHLHE40O14503 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
BHLHE40O14503 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
BHLHE40O14503 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
BHLHE40O14503 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
BHLHE40O14503 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
BHLHE40O14503 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
BHLHE40O14503 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
BHLHE40O14503 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
BHLHE40O14503 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
BHLHE40O14503 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
BHLHE40O14503 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
BHLHE40O14503 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
BHLHE40O14503 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
BHLHE40O14503 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
BHLHE40O14503 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
BHLHE40O14503 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
BHLHE40O14503 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
BHLHE40O14503 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
BHLHE40O14503 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
BHLHE40O14503 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
BHLHE40O14503 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
BHLHE40O14503 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
BHLHE40O14503 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
BHLHE40O14503 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
BHLHE40O14503 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
BHLHE40O14503 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
BHLHE40O14503 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
BHLHE40O14503 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
BHLHE40O14503 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
BHLHE40O14503 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
BHLHE40O14503 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
BHLHE40O14503 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
BHLHE40O14503 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
BHLHE40O14503 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
BHLHE40O14503 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
BHLHE40O14503 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
BHLHE40O14503 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BHLHE40O14503 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
BHLHE40O14503 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BHLHE40O14503 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
BHLHE40O14503 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BHLHE40O14503 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BHLHE40O14503 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
BHLHE40O14503 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BHLHE40O14503 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BHLHE40O14503 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
BHLHE40O14503 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
BHLHE40O14503 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
BHLHE40O14503 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BHLHE40O14503 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BHLHE40O14503 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BHLHE40O14503 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BHLHE40O14503 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BHLHE40O14503 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BHLHE40O14503 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BHLHE40O14503 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
BHLHE40O14503 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
BHLHE40O14503 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
BHLHE40O14503 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BHLHE40O14503 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
BHLHE40O14503 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
BHLHE40O14503 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
BHLHE40O14503 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
BHLHE40O14503 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
BHLHE40O14503 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
BHLHE40O14503 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
BHLHE40O14503 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
BHLHE40O14503 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BHLHE40O14503 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BHLHE40O14503 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
BHLHE40O14503 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
BHLHE40O14503 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
BHLHE40O14503 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BHLHE40O14503 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
BHLHE40O14503 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BHLHE40O14503 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BHLHE40O14503 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BHLHE40O14503 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BHLHE40O14503 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
BHLHE40O14503 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
BHLHE40O14503 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
BHLHE40O14503 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
BHLHE40O14503 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BHLHE40O14503 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BHLHE40O14503 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BHLHE40O14503 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
BHLHE40O14503 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
BHLHE40O14503 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
BHLHE40O14503 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BHLHE40O14503 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BHLHE40O14503 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BHLHE40O14503 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.9 ms