Protein–RNA interactions for Protein: K7ER74

APOC4-APOC2, APOC4-APOC2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC4-APOC2K7ER74 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
APOC4-APOC2K7ER74 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
APOC4-APOC2K7ER74 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
APOC4-APOC2K7ER74 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
APOC4-APOC2K7ER74 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
APOC4-APOC2K7ER74 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
APOC4-APOC2K7ER74 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
APOC4-APOC2K7ER74 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
APOC4-APOC2K7ER74 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
APOC4-APOC2K7ER74 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
APOC4-APOC2K7ER74 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
APOC4-APOC2K7ER74 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
APOC4-APOC2K7ER74 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
APOC4-APOC2K7ER74 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
APOC4-APOC2K7ER74 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
APOC4-APOC2K7ER74 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
APOC4-APOC2K7ER74 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
APOC4-APOC2K7ER74 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
APOC4-APOC2K7ER74 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
APOC4-APOC2K7ER74 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
APOC4-APOC2K7ER74 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
APOC4-APOC2K7ER74 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
APOC4-APOC2K7ER74 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
APOC4-APOC2K7ER74 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
APOC4-APOC2K7ER74 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
APOC4-APOC2K7ER74 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
APOC4-APOC2K7ER74 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
APOC4-APOC2K7ER74 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
APOC4-APOC2K7ER74 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
APOC4-APOC2K7ER74 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
APOC4-APOC2K7ER74 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
APOC4-APOC2K7ER74 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
APOC4-APOC2K7ER74 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
APOC4-APOC2K7ER74 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
APOC4-APOC2K7ER74 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
APOC4-APOC2K7ER74 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
APOC4-APOC2K7ER74 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
APOC4-APOC2K7ER74 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
APOC4-APOC2K7ER74 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
APOC4-APOC2K7ER74 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
APOC4-APOC2K7ER74 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
APOC4-APOC2K7ER74 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
APOC4-APOC2K7ER74 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
APOC4-APOC2K7ER74 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
APOC4-APOC2K7ER74 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
APOC4-APOC2K7ER74 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
APOC4-APOC2K7ER74 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
APOC4-APOC2K7ER74 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
APOC4-APOC2K7ER74 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
APOC4-APOC2K7ER74 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
APOC4-APOC2K7ER74 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
APOC4-APOC2K7ER74 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
APOC4-APOC2K7ER74 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
APOC4-APOC2K7ER74 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
APOC4-APOC2K7ER74 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
APOC4-APOC2K7ER74 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
APOC4-APOC2K7ER74 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
APOC4-APOC2K7ER74 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
APOC4-APOC2K7ER74 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
APOC4-APOC2K7ER74 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
APOC4-APOC2K7ER74 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
APOC4-APOC2K7ER74 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
APOC4-APOC2K7ER74 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
APOC4-APOC2K7ER74 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
APOC4-APOC2K7ER74 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
APOC4-APOC2K7ER74 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
APOC4-APOC2K7ER74 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
APOC4-APOC2K7ER74 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
APOC4-APOC2K7ER74 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
APOC4-APOC2K7ER74 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
APOC4-APOC2K7ER74 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
APOC4-APOC2K7ER74 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
APOC4-APOC2K7ER74 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
APOC4-APOC2K7ER74 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
APOC4-APOC2K7ER74 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
APOC4-APOC2K7ER74 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
APOC4-APOC2K7ER74 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
APOC4-APOC2K7ER74 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
APOC4-APOC2K7ER74 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
APOC4-APOC2K7ER74 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
APOC4-APOC2K7ER74 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
APOC4-APOC2K7ER74 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
APOC4-APOC2K7ER74 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
APOC4-APOC2K7ER74 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
APOC4-APOC2K7ER74 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
APOC4-APOC2K7ER74 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
APOC4-APOC2K7ER74 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
APOC4-APOC2K7ER74 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
APOC4-APOC2K7ER74 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
APOC4-APOC2K7ER74 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
APOC4-APOC2K7ER74 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
APOC4-APOC2K7ER74 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
APOC4-APOC2K7ER74 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
APOC4-APOC2K7ER74 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
APOC4-APOC2K7ER74 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
APOC4-APOC2K7ER74 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
APOC4-APOC2K7ER74 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
APOC4-APOC2K7ER74 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
APOC4-APOC2K7ER74 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
APOC4-APOC2K7ER74 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms