Protein–RNA interactions for Protein: C9JSJ3

BHMG1, Basic helix-loop-helix and HMG box domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHMG1C9JSJ3 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
BHMG1C9JSJ3 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
BHMG1C9JSJ3 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
BHMG1C9JSJ3 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
BHMG1C9JSJ3 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
BHMG1C9JSJ3 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
BHMG1C9JSJ3 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
BHMG1C9JSJ3 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
BHMG1C9JSJ3 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
BHMG1C9JSJ3 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
BHMG1C9JSJ3 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
BHMG1C9JSJ3 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
BHMG1C9JSJ3 KRTAP4-4-201ENST00000390661 1081 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
BHMG1C9JSJ3 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
BHMG1C9JSJ3 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
BHMG1C9JSJ3 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
BHMG1C9JSJ3 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
BHMG1C9JSJ3 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
BHMG1C9JSJ3 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
BHMG1C9JSJ3 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
BHMG1C9JSJ3 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
BHMG1C9JSJ3 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
BHMG1C9JSJ3 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
BHMG1C9JSJ3 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
BHMG1C9JSJ3 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
BHMG1C9JSJ3 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
BHMG1C9JSJ3 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
BHMG1C9JSJ3 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
BHMG1C9JSJ3 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
BHMG1C9JSJ3 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
BHMG1C9JSJ3 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
BHMG1C9JSJ3 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
BHMG1C9JSJ3 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
BHMG1C9JSJ3 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
BHMG1C9JSJ3 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
BHMG1C9JSJ3 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
BHMG1C9JSJ3 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
BHMG1C9JSJ3 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
BHMG1C9JSJ3 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
BHMG1C9JSJ3 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
BHMG1C9JSJ3 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
BHMG1C9JSJ3 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
BHMG1C9JSJ3 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
BHMG1C9JSJ3 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
BHMG1C9JSJ3 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
BHMG1C9JSJ3 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
BHMG1C9JSJ3 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
BHMG1C9JSJ3 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
BHMG1C9JSJ3 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
BHMG1C9JSJ3 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
BHMG1C9JSJ3 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
BHMG1C9JSJ3 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
BHMG1C9JSJ3 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
BHMG1C9JSJ3 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
BHMG1C9JSJ3 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
BHMG1C9JSJ3 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
BHMG1C9JSJ3 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
BHMG1C9JSJ3 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
BHMG1C9JSJ3 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
BHMG1C9JSJ3 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
BHMG1C9JSJ3 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
BHMG1C9JSJ3 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
BHMG1C9JSJ3 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
BHMG1C9JSJ3 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
BHMG1C9JSJ3 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
BHMG1C9JSJ3 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
BHMG1C9JSJ3 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
BHMG1C9JSJ3 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
BHMG1C9JSJ3 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
BHMG1C9JSJ3 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
BHMG1C9JSJ3 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
BHMG1C9JSJ3 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
BHMG1C9JSJ3 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
BHMG1C9JSJ3 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BHMG1C9JSJ3 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BHMG1C9JSJ3 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BHMG1C9JSJ3 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
BHMG1C9JSJ3 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
BHMG1C9JSJ3 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BHMG1C9JSJ3 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
BHMG1C9JSJ3 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BHMG1C9JSJ3 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BHMG1C9JSJ3 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
BHMG1C9JSJ3 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BHMG1C9JSJ3 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BHMG1C9JSJ3 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
BHMG1C9JSJ3 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
BHMG1C9JSJ3 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BHMG1C9JSJ3 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BHMG1C9JSJ3 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
BHMG1C9JSJ3 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
BHMG1C9JSJ3 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
BHMG1C9JSJ3 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
BHMG1C9JSJ3 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
BHMG1C9JSJ3 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
BHMG1C9JSJ3 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
BHMG1C9JSJ3 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
BHMG1C9JSJ3 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
BHMG1C9JSJ3 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
BHMG1C9JSJ3 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms