Protein–RNA interactions for Protein: A6NH52

TVP23A, Golgi apparatus membrane protein TVP23 homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TVP23AA6NH52 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TVP23AA6NH52 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TVP23AA6NH52 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TVP23AA6NH52 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TVP23AA6NH52 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TVP23AA6NH52 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TVP23AA6NH52 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TVP23AA6NH52 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TVP23AA6NH52 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TVP23AA6NH52 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TVP23AA6NH52 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TVP23AA6NH52 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TVP23AA6NH52 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TVP23AA6NH52 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TVP23AA6NH52 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TVP23AA6NH52 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TVP23AA6NH52 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TVP23AA6NH52 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TVP23AA6NH52 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TVP23AA6NH52 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TVP23AA6NH52 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TVP23AA6NH52 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TVP23AA6NH52 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TVP23AA6NH52 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TVP23AA6NH52 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TVP23AA6NH52 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TVP23AA6NH52 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TVP23AA6NH52 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TVP23AA6NH52 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TVP23AA6NH52 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TVP23AA6NH52 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TVP23AA6NH52 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TVP23AA6NH52 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TVP23AA6NH52 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TVP23AA6NH52 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TVP23AA6NH52 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TVP23AA6NH52 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TVP23AA6NH52 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TVP23AA6NH52 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TVP23AA6NH52 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TVP23AA6NH52 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TVP23AA6NH52 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TVP23AA6NH52 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TVP23AA6NH52 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TVP23AA6NH52 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TVP23AA6NH52 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TVP23AA6NH52 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TVP23AA6NH52 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TVP23AA6NH52 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TVP23AA6NH52 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TVP23AA6NH52 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TVP23AA6NH52 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TVP23AA6NH52 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TVP23AA6NH52 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TVP23AA6NH52 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TVP23AA6NH52 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TVP23AA6NH52 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TVP23AA6NH52 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TVP23AA6NH52 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TVP23AA6NH52 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TVP23AA6NH52 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TVP23AA6NH52 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TVP23AA6NH52 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TVP23AA6NH52 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TVP23AA6NH52 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TVP23AA6NH52 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TVP23AA6NH52 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
TVP23AA6NH52 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
TVP23AA6NH52 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TVP23AA6NH52 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
TVP23AA6NH52 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TVP23AA6NH52 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
TVP23AA6NH52 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TVP23AA6NH52 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TVP23AA6NH52 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TVP23AA6NH52 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TVP23AA6NH52 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TVP23AA6NH52 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TVP23AA6NH52 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TVP23AA6NH52 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TVP23AA6NH52 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TVP23AA6NH52 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TVP23AA6NH52 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TVP23AA6NH52 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TVP23AA6NH52 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TVP23AA6NH52 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TVP23AA6NH52 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TVP23AA6NH52 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TVP23AA6NH52 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TVP23AA6NH52 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TVP23AA6NH52 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TVP23AA6NH52 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TVP23AA6NH52 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TVP23AA6NH52 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TVP23AA6NH52 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TVP23AA6NH52 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TVP23AA6NH52 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TVP23AA6NH52 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TVP23AA6NH52 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TVP23AA6NH52 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms