Protein–RNA interactions for Protein: V9GYD0

ARL2-SNX15, ARL2-SNX15 readthrough (NMD candidate), humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL2-SNX15V9GYD0 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ARL2-SNX15V9GYD0 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ARL2-SNX15V9GYD0 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
ARL2-SNX15V9GYD0 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ARL2-SNX15V9GYD0 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
ARL2-SNX15V9GYD0 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
ARL2-SNX15V9GYD0 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ARL2-SNX15V9GYD0 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ARL2-SNX15V9GYD0 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ARL2-SNX15V9GYD0 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ARL2-SNX15V9GYD0 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
ARL2-SNX15V9GYD0 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ARL2-SNX15V9GYD0 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ARL2-SNX15V9GYD0 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ARL2-SNX15V9GYD0 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ARL2-SNX15V9GYD0 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ARL2-SNX15V9GYD0 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ARL2-SNX15V9GYD0 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ARL2-SNX15V9GYD0 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ARL2-SNX15V9GYD0 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ARL2-SNX15V9GYD0 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ARL2-SNX15V9GYD0 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ARL2-SNX15V9GYD0 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ARL2-SNX15V9GYD0 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ARL2-SNX15V9GYD0 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ARL2-SNX15V9GYD0 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ARL2-SNX15V9GYD0 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ARL2-SNX15V9GYD0 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ARL2-SNX15V9GYD0 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ARL2-SNX15V9GYD0 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ARL2-SNX15V9GYD0 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ARL2-SNX15V9GYD0 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ARL2-SNX15V9GYD0 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ARL2-SNX15V9GYD0 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ARL2-SNX15V9GYD0 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ARL2-SNX15V9GYD0 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ARL2-SNX15V9GYD0 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ARL2-SNX15V9GYD0 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ARL2-SNX15V9GYD0 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ARL2-SNX15V9GYD0 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ARL2-SNX15V9GYD0 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ARL2-SNX15V9GYD0 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ARL2-SNX15V9GYD0 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ARL2-SNX15V9GYD0 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ARL2-SNX15V9GYD0 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ARL2-SNX15V9GYD0 ZKSCAN2-201ENST00000328086 7523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ARL2-SNX15V9GYD0 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ARL2-SNX15V9GYD0 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ARL2-SNX15V9GYD0 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ARL2-SNX15V9GYD0 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ARL2-SNX15V9GYD0 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ARL2-SNX15V9GYD0 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ARL2-SNX15V9GYD0 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ARL2-SNX15V9GYD0 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ARL2-SNX15V9GYD0 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ARL2-SNX15V9GYD0 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ARL2-SNX15V9GYD0 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ARL2-SNX15V9GYD0 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ARL2-SNX15V9GYD0 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ARL2-SNX15V9GYD0 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
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ARL2-SNX15V9GYD0 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ARL2-SNX15V9GYD0 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ARL2-SNX15V9GYD0 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
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ARL2-SNX15V9GYD0 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ARL2-SNX15V9GYD0 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ARL2-SNX15V9GYD0 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ARL2-SNX15V9GYD0 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ARL2-SNX15V9GYD0 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ARL2-SNX15V9GYD0 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ARL2-SNX15V9GYD0 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ARL2-SNX15V9GYD0 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ARL2-SNX15V9GYD0 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ARL2-SNX15V9GYD0 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ARL2-SNX15V9GYD0 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ARL2-SNX15V9GYD0 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ARL2-SNX15V9GYD0 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
ARL2-SNX15V9GYD0 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ARL2-SNX15V9GYD0 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ARL2-SNX15V9GYD0 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ARL2-SNX15V9GYD0 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ARL2-SNX15V9GYD0 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ARL2-SNX15V9GYD0 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ARL2-SNX15V9GYD0 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ARL2-SNX15V9GYD0 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ARL2-SNX15V9GYD0 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
ARL2-SNX15V9GYD0 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ARL2-SNX15V9GYD0 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ARL2-SNX15V9GYD0 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ARL2-SNX15V9GYD0 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ARL2-SNX15V9GYD0 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ARL2-SNX15V9GYD0 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ARL2-SNX15V9GYD0 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ARL2-SNX15V9GYD0 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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