Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3A2

UTP11, Probable U3 small nucleolar RNA-associated protein 11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 253 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP11Q9Y3A2 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
UTP11Q9Y3A2 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
UTP11Q9Y3A2 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
UTP11Q9Y3A2 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
UTP11Q9Y3A2 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
UTP11Q9Y3A2 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
UTP11Q9Y3A2 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
UTP11Q9Y3A2 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
UTP11Q9Y3A2 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
UTP11Q9Y3A2 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
UTP11Q9Y3A2 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
UTP11Q9Y3A2 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
UTP11Q9Y3A2 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
UTP11Q9Y3A2 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
UTP11Q9Y3A2 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
UTP11Q9Y3A2 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
UTP11Q9Y3A2 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
UTP11Q9Y3A2 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
UTP11Q9Y3A2 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
UTP11Q9Y3A2 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
UTP11Q9Y3A2 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
UTP11Q9Y3A2 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
UTP11Q9Y3A2 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
UTP11Q9Y3A2 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
UTP11Q9Y3A2 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
UTP11Q9Y3A2 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
UTP11Q9Y3A2 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
UTP11Q9Y3A2 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
UTP11Q9Y3A2 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
UTP11Q9Y3A2 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
UTP11Q9Y3A2 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
UTP11Q9Y3A2 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
UTP11Q9Y3A2 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
UTP11Q9Y3A2 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
UTP11Q9Y3A2 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
UTP11Q9Y3A2 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
UTP11Q9Y3A2 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
UTP11Q9Y3A2 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
UTP11Q9Y3A2 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
UTP11Q9Y3A2 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
UTP11Q9Y3A2 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
UTP11Q9Y3A2 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
UTP11Q9Y3A2 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
UTP11Q9Y3A2 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
UTP11Q9Y3A2 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
UTP11Q9Y3A2 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
UTP11Q9Y3A2 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
UTP11Q9Y3A2 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
UTP11Q9Y3A2 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
UTP11Q9Y3A2 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
UTP11Q9Y3A2 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
UTP11Q9Y3A2 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
UTP11Q9Y3A2 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
UTP11Q9Y3A2 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
UTP11Q9Y3A2 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
UTP11Q9Y3A2 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
UTP11Q9Y3A2 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
UTP11Q9Y3A2 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
UTP11Q9Y3A2 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
UTP11Q9Y3A2 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
UTP11Q9Y3A2 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
UTP11Q9Y3A2 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
UTP11Q9Y3A2 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
UTP11Q9Y3A2 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
UTP11Q9Y3A2 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
UTP11Q9Y3A2 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
UTP11Q9Y3A2 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
UTP11Q9Y3A2 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
UTP11Q9Y3A2 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
UTP11Q9Y3A2 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
UTP11Q9Y3A2 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
UTP11Q9Y3A2 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
UTP11Q9Y3A2 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
UTP11Q9Y3A2 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
UTP11Q9Y3A2 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
UTP11Q9Y3A2 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
UTP11Q9Y3A2 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
UTP11Q9Y3A2 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
UTP11Q9Y3A2 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
UTP11Q9Y3A2 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
UTP11Q9Y3A2 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
UTP11Q9Y3A2 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
UTP11Q9Y3A2 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
UTP11Q9Y3A2 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
UTP11Q9Y3A2 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
UTP11Q9Y3A2 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
UTP11Q9Y3A2 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
UTP11Q9Y3A2 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
UTP11Q9Y3A2 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
UTP11Q9Y3A2 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
UTP11Q9Y3A2 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
UTP11Q9Y3A2 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
UTP11Q9Y3A2 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
UTP11Q9Y3A2 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
UTP11Q9Y3A2 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
UTP11Q9Y3A2 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
UTP11Q9Y3A2 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
UTP11Q9Y3A2 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
UTP11Q9Y3A2 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
UTP11Q9Y3A2 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms