Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJD0

RIMS3, Regulating synaptic membrane exocytosis protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIMS3Q9UJD0 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RIMS3Q9UJD0 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RIMS3Q9UJD0 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RIMS3Q9UJD0 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RIMS3Q9UJD0 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RIMS3Q9UJD0 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RIMS3Q9UJD0 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RIMS3Q9UJD0 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
RIMS3Q9UJD0 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RIMS3Q9UJD0 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RIMS3Q9UJD0 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RIMS3Q9UJD0 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RIMS3Q9UJD0 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RIMS3Q9UJD0 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RIMS3Q9UJD0 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RIMS3Q9UJD0 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RIMS3Q9UJD0 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
RIMS3Q9UJD0 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RIMS3Q9UJD0 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RIMS3Q9UJD0 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RIMS3Q9UJD0 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RIMS3Q9UJD0 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RIMS3Q9UJD0 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RIMS3Q9UJD0 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RIMS3Q9UJD0 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RIMS3Q9UJD0 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RIMS3Q9UJD0 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RIMS3Q9UJD0 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RIMS3Q9UJD0 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RIMS3Q9UJD0 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RIMS3Q9UJD0 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RIMS3Q9UJD0 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RIMS3Q9UJD0 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RIMS3Q9UJD0 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RIMS3Q9UJD0 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RIMS3Q9UJD0 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RIMS3Q9UJD0 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RIMS3Q9UJD0 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RIMS3Q9UJD0 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RIMS3Q9UJD0 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RIMS3Q9UJD0 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RIMS3Q9UJD0 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RIMS3Q9UJD0 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RIMS3Q9UJD0 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RIMS3Q9UJD0 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RIMS3Q9UJD0 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RIMS3Q9UJD0 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RIMS3Q9UJD0 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RIMS3Q9UJD0 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RIMS3Q9UJD0 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RIMS3Q9UJD0 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RIMS3Q9UJD0 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RIMS3Q9UJD0 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RIMS3Q9UJD0 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RIMS3Q9UJD0 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RIMS3Q9UJD0 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RIMS3Q9UJD0 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RIMS3Q9UJD0 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RIMS3Q9UJD0 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RIMS3Q9UJD0 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RIMS3Q9UJD0 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RIMS3Q9UJD0 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RIMS3Q9UJD0 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RIMS3Q9UJD0 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RIMS3Q9UJD0 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RIMS3Q9UJD0 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RIMS3Q9UJD0 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RIMS3Q9UJD0 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RIMS3Q9UJD0 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RIMS3Q9UJD0 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RIMS3Q9UJD0 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
RIMS3Q9UJD0 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RIMS3Q9UJD0 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RIMS3Q9UJD0 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RIMS3Q9UJD0 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RIMS3Q9UJD0 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RIMS3Q9UJD0 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RIMS3Q9UJD0 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RIMS3Q9UJD0 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
RIMS3Q9UJD0 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RIMS3Q9UJD0 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RIMS3Q9UJD0 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RIMS3Q9UJD0 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RIMS3Q9UJD0 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RIMS3Q9UJD0 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RIMS3Q9UJD0 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RIMS3Q9UJD0 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RIMS3Q9UJD0 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
RIMS3Q9UJD0 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RIMS3Q9UJD0 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RIMS3Q9UJD0 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RIMS3Q9UJD0 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RIMS3Q9UJD0 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RIMS3Q9UJD0 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RIMS3Q9UJD0 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RIMS3Q9UJD0 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RIMS3Q9UJD0 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RIMS3Q9UJD0 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RIMS3Q9UJD0 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RIMS3Q9UJD0 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms