Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGV2

NDRG3, Protein NDRG3, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDRG3Q9UGV2 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NDRG3Q9UGV2 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NDRG3Q9UGV2 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NDRG3Q9UGV2 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NDRG3Q9UGV2 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NDRG3Q9UGV2 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NDRG3Q9UGV2 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NDRG3Q9UGV2 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NDRG3Q9UGV2 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NDRG3Q9UGV2 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NDRG3Q9UGV2 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NDRG3Q9UGV2 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NDRG3Q9UGV2 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NDRG3Q9UGV2 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NDRG3Q9UGV2 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NDRG3Q9UGV2 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NDRG3Q9UGV2 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NDRG3Q9UGV2 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NDRG3Q9UGV2 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NDRG3Q9UGV2 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NDRG3Q9UGV2 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NDRG3Q9UGV2 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NDRG3Q9UGV2 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NDRG3Q9UGV2 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NDRG3Q9UGV2 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NDRG3Q9UGV2 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NDRG3Q9UGV2 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NDRG3Q9UGV2 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
NDRG3Q9UGV2 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NDRG3Q9UGV2 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NDRG3Q9UGV2 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NDRG3Q9UGV2 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NDRG3Q9UGV2 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NDRG3Q9UGV2 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NDRG3Q9UGV2 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NDRG3Q9UGV2 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NDRG3Q9UGV2 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NDRG3Q9UGV2 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NDRG3Q9UGV2 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
NDRG3Q9UGV2 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
NDRG3Q9UGV2 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NDRG3Q9UGV2 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NDRG3Q9UGV2 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NDRG3Q9UGV2 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
NDRG3Q9UGV2 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NDRG3Q9UGV2 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
NDRG3Q9UGV2 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
NDRG3Q9UGV2 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
NDRG3Q9UGV2 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
NDRG3Q9UGV2 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NDRG3Q9UGV2 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NDRG3Q9UGV2 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NDRG3Q9UGV2 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NDRG3Q9UGV2 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NDRG3Q9UGV2 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NDRG3Q9UGV2 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NDRG3Q9UGV2 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NDRG3Q9UGV2 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NDRG3Q9UGV2 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NDRG3Q9UGV2 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NDRG3Q9UGV2 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NDRG3Q9UGV2 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NDRG3Q9UGV2 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NDRG3Q9UGV2 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NDRG3Q9UGV2 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NDRG3Q9UGV2 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
NDRG3Q9UGV2 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NDRG3Q9UGV2 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
NDRG3Q9UGV2 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NDRG3Q9UGV2 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NDRG3Q9UGV2 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NDRG3Q9UGV2 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NDRG3Q9UGV2 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
NDRG3Q9UGV2 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NDRG3Q9UGV2 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NDRG3Q9UGV2 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NDRG3Q9UGV2 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NDRG3Q9UGV2 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NDRG3Q9UGV2 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NDRG3Q9UGV2 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NDRG3Q9UGV2 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NDRG3Q9UGV2 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NDRG3Q9UGV2 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
NDRG3Q9UGV2 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NDRG3Q9UGV2 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NDRG3Q9UGV2 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NDRG3Q9UGV2 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NDRG3Q9UGV2 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NDRG3Q9UGV2 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NDRG3Q9UGV2 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NDRG3Q9UGV2 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NDRG3Q9UGV2 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NDRG3Q9UGV2 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NDRG3Q9UGV2 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NDRG3Q9UGV2 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NDRG3Q9UGV2 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NDRG3Q9UGV2 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NDRG3Q9UGV2 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NDRG3Q9UGV2 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NDRG3Q9UGV2 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms