Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBN4

TRPC4, Short transient receptor potential channel 4, humanhuman

Predictions only

Length 977 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPC4Q9UBN4 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRPC4Q9UBN4 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRPC4Q9UBN4 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
TRPC4Q9UBN4 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRPC4Q9UBN4 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRPC4Q9UBN4 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRPC4Q9UBN4 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRPC4Q9UBN4 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRPC4Q9UBN4 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRPC4Q9UBN4 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRPC4Q9UBN4 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRPC4Q9UBN4 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRPC4Q9UBN4 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRPC4Q9UBN4 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRPC4Q9UBN4 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRPC4Q9UBN4 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRPC4Q9UBN4 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRPC4Q9UBN4 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRPC4Q9UBN4 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRPC4Q9UBN4 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRPC4Q9UBN4 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRPC4Q9UBN4 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRPC4Q9UBN4 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRPC4Q9UBN4 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRPC4Q9UBN4 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRPC4Q9UBN4 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRPC4Q9UBN4 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRPC4Q9UBN4 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRPC4Q9UBN4 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRPC4Q9UBN4 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRPC4Q9UBN4 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRPC4Q9UBN4 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRPC4Q9UBN4 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRPC4Q9UBN4 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRPC4Q9UBN4 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRPC4Q9UBN4 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRPC4Q9UBN4 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRPC4Q9UBN4 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRPC4Q9UBN4 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRPC4Q9UBN4 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRPC4Q9UBN4 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRPC4Q9UBN4 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRPC4Q9UBN4 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRPC4Q9UBN4 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRPC4Q9UBN4 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRPC4Q9UBN4 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRPC4Q9UBN4 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRPC4Q9UBN4 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRPC4Q9UBN4 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRPC4Q9UBN4 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRPC4Q9UBN4 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRPC4Q9UBN4 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRPC4Q9UBN4 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRPC4Q9UBN4 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRPC4Q9UBN4 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRPC4Q9UBN4 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRPC4Q9UBN4 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRPC4Q9UBN4 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRPC4Q9UBN4 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRPC4Q9UBN4 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRPC4Q9UBN4 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRPC4Q9UBN4 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRPC4Q9UBN4 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
TRPC4Q9UBN4 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRPC4Q9UBN4 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRPC4Q9UBN4 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRPC4Q9UBN4 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRPC4Q9UBN4 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRPC4Q9UBN4 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRPC4Q9UBN4 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRPC4Q9UBN4 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRPC4Q9UBN4 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRPC4Q9UBN4 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRPC4Q9UBN4 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRPC4Q9UBN4 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRPC4Q9UBN4 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRPC4Q9UBN4 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRPC4Q9UBN4 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRPC4Q9UBN4 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRPC4Q9UBN4 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRPC4Q9UBN4 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
TRPC4Q9UBN4 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRPC4Q9UBN4 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRPC4Q9UBN4 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRPC4Q9UBN4 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
TRPC4Q9UBN4 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRPC4Q9UBN4 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRPC4Q9UBN4 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRPC4Q9UBN4 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRPC4Q9UBN4 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRPC4Q9UBN4 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
TRPC4Q9UBN4 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRPC4Q9UBN4 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRPC4Q9UBN4 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRPC4Q9UBN4 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRPC4Q9UBN4 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRPC4Q9UBN4 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRPC4Q9UBN4 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
TRPC4Q9UBN4 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRPC4Q9UBN4 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms