Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2A4

ABI3, ABI gene family member 3, humanhuman

Predictions only

Length 366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABI3Q9P2A4 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ABI3Q9P2A4 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ABI3Q9P2A4 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ABI3Q9P2A4 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ABI3Q9P2A4 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ABI3Q9P2A4 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ABI3Q9P2A4 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ABI3Q9P2A4 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ABI3Q9P2A4 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ABI3Q9P2A4 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ABI3Q9P2A4 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ABI3Q9P2A4 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ABI3Q9P2A4 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ABI3Q9P2A4 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ABI3Q9P2A4 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ABI3Q9P2A4 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ABI3Q9P2A4 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ABI3Q9P2A4 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ABI3Q9P2A4 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ABI3Q9P2A4 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ABI3Q9P2A4 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ABI3Q9P2A4 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ABI3Q9P2A4 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ABI3Q9P2A4 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ABI3Q9P2A4 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ABI3Q9P2A4 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ABI3Q9P2A4 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ABI3Q9P2A4 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ABI3Q9P2A4 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ABI3Q9P2A4 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ABI3Q9P2A4 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ABI3Q9P2A4 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ABI3Q9P2A4 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ABI3Q9P2A4 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ABI3Q9P2A4 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ABI3Q9P2A4 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ABI3Q9P2A4 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ABI3Q9P2A4 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ABI3Q9P2A4 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ABI3Q9P2A4 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ABI3Q9P2A4 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ABI3Q9P2A4 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ABI3Q9P2A4 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ABI3Q9P2A4 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ABI3Q9P2A4 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ABI3Q9P2A4 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ABI3Q9P2A4 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ABI3Q9P2A4 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ABI3Q9P2A4 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ABI3Q9P2A4 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ABI3Q9P2A4 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ABI3Q9P2A4 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ABI3Q9P2A4 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ABI3Q9P2A4 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ABI3Q9P2A4 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ABI3Q9P2A4 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ABI3Q9P2A4 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ABI3Q9P2A4 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ABI3Q9P2A4 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ABI3Q9P2A4 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ABI3Q9P2A4 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ABI3Q9P2A4 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ABI3Q9P2A4 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ABI3Q9P2A4 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ABI3Q9P2A4 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ABI3Q9P2A4 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ABI3Q9P2A4 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ABI3Q9P2A4 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ABI3Q9P2A4 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ABI3Q9P2A4 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ABI3Q9P2A4 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ABI3Q9P2A4 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ABI3Q9P2A4 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ABI3Q9P2A4 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ABI3Q9P2A4 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ABI3Q9P2A4 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ABI3Q9P2A4 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ABI3Q9P2A4 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ABI3Q9P2A4 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ABI3Q9P2A4 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ABI3Q9P2A4 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ABI3Q9P2A4 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ABI3Q9P2A4 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ABI3Q9P2A4 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ABI3Q9P2A4 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ABI3Q9P2A4 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ABI3Q9P2A4 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ABI3Q9P2A4 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
ABI3Q9P2A4 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ABI3Q9P2A4 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ABI3Q9P2A4 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ABI3Q9P2A4 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
ABI3Q9P2A4 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ABI3Q9P2A4 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ABI3Q9P2A4 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ABI3Q9P2A4 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ABI3Q9P2A4 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
ABI3Q9P2A4 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
ABI3Q9P2A4 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
ABI3Q9P2A4 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms