Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0U4

CXXC1, CXXC-type zinc finger protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXXC1Q9P0U4 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CXXC1Q9P0U4 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CXXC1Q9P0U4 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CXXC1Q9P0U4 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CXXC1Q9P0U4 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CXXC1Q9P0U4 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CXXC1Q9P0U4 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CXXC1Q9P0U4 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CXXC1Q9P0U4 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CXXC1Q9P0U4 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CXXC1Q9P0U4 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CXXC1Q9P0U4 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CXXC1Q9P0U4 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CXXC1Q9P0U4 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CXXC1Q9P0U4 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CXXC1Q9P0U4 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CXXC1Q9P0U4 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CXXC1Q9P0U4 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CXXC1Q9P0U4 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CXXC1Q9P0U4 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CXXC1Q9P0U4 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CXXC1Q9P0U4 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CXXC1Q9P0U4 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CXXC1Q9P0U4 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CXXC1Q9P0U4 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CXXC1Q9P0U4 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CXXC1Q9P0U4 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CXXC1Q9P0U4 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CXXC1Q9P0U4 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CXXC1Q9P0U4 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CXXC1Q9P0U4 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CXXC1Q9P0U4 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CXXC1Q9P0U4 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CXXC1Q9P0U4 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CXXC1Q9P0U4 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CXXC1Q9P0U4 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CXXC1Q9P0U4 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CXXC1Q9P0U4 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CXXC1Q9P0U4 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CXXC1Q9P0U4 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CXXC1Q9P0U4 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CXXC1Q9P0U4 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CXXC1Q9P0U4 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CXXC1Q9P0U4 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CXXC1Q9P0U4 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CXXC1Q9P0U4 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CXXC1Q9P0U4 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CXXC1Q9P0U4 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CXXC1Q9P0U4 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CXXC1Q9P0U4 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CXXC1Q9P0U4 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CXXC1Q9P0U4 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CXXC1Q9P0U4 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CXXC1Q9P0U4 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CXXC1Q9P0U4 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CXXC1Q9P0U4 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CXXC1Q9P0U4 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CXXC1Q9P0U4 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CXXC1Q9P0U4 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CXXC1Q9P0U4 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CXXC1Q9P0U4 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CXXC1Q9P0U4 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CXXC1Q9P0U4 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CXXC1Q9P0U4 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CXXC1Q9P0U4 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CXXC1Q9P0U4 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CXXC1Q9P0U4 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CXXC1Q9P0U4 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CXXC1Q9P0U4 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CXXC1Q9P0U4 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CXXC1Q9P0U4 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CXXC1Q9P0U4 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CXXC1Q9P0U4 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CXXC1Q9P0U4 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CXXC1Q9P0U4 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CXXC1Q9P0U4 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CXXC1Q9P0U4 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CXXC1Q9P0U4 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CXXC1Q9P0U4 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CXXC1Q9P0U4 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CXXC1Q9P0U4 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CXXC1Q9P0U4 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CXXC1Q9P0U4 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CXXC1Q9P0U4 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CXXC1Q9P0U4 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CXXC1Q9P0U4 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CXXC1Q9P0U4 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CXXC1Q9P0U4 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CXXC1Q9P0U4 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CXXC1Q9P0U4 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CXXC1Q9P0U4 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CXXC1Q9P0U4 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CXXC1Q9P0U4 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CXXC1Q9P0U4 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CXXC1Q9P0U4 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CXXC1Q9P0U4 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CXXC1Q9P0U4 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CXXC1Q9P0U4 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CXXC1Q9P0U4 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
CXXC1Q9P0U4 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms