Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWW5

CLN6, Ceroid-lipofuscinosis neuronal protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN6Q9NWW5 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLN6Q9NWW5 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLN6Q9NWW5 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLN6Q9NWW5 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLN6Q9NWW5 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLN6Q9NWW5 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLN6Q9NWW5 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLN6Q9NWW5 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLN6Q9NWW5 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLN6Q9NWW5 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLN6Q9NWW5 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLN6Q9NWW5 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLN6Q9NWW5 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLN6Q9NWW5 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLN6Q9NWW5 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLN6Q9NWW5 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLN6Q9NWW5 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLN6Q9NWW5 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLN6Q9NWW5 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLN6Q9NWW5 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLN6Q9NWW5 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLN6Q9NWW5 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLN6Q9NWW5 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CLN6Q9NWW5 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLN6Q9NWW5 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLN6Q9NWW5 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLN6Q9NWW5 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLN6Q9NWW5 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLN6Q9NWW5 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLN6Q9NWW5 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLN6Q9NWW5 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLN6Q9NWW5 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLN6Q9NWW5 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.14
CLN6Q9NWW5 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLN6Q9NWW5 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLN6Q9NWW5 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLN6Q9NWW5 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLN6Q9NWW5 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLN6Q9NWW5 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLN6Q9NWW5 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLN6Q9NWW5 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLN6Q9NWW5 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLN6Q9NWW5 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLN6Q9NWW5 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLN6Q9NWW5 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLN6Q9NWW5 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLN6Q9NWW5 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLN6Q9NWW5 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLN6Q9NWW5 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CLN6Q9NWW5 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CLN6Q9NWW5 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLN6Q9NWW5 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLN6Q9NWW5 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLN6Q9NWW5 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CLN6Q9NWW5 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLN6Q9NWW5 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CLN6Q9NWW5 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CLN6Q9NWW5 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLN6Q9NWW5 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLN6Q9NWW5 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CLN6Q9NWW5 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLN6Q9NWW5 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLN6Q9NWW5 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLN6Q9NWW5 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLN6Q9NWW5 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLN6Q9NWW5 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLN6Q9NWW5 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLN6Q9NWW5 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLN6Q9NWW5 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLN6Q9NWW5 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLN6Q9NWW5 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLN6Q9NWW5 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLN6Q9NWW5 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLN6Q9NWW5 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLN6Q9NWW5 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLN6Q9NWW5 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLN6Q9NWW5 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLN6Q9NWW5 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLN6Q9NWW5 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLN6Q9NWW5 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLN6Q9NWW5 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLN6Q9NWW5 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLN6Q9NWW5 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLN6Q9NWW5 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLN6Q9NWW5 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLN6Q9NWW5 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLN6Q9NWW5 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLN6Q9NWW5 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLN6Q9NWW5 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLN6Q9NWW5 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLN6Q9NWW5 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLN6Q9NWW5 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLN6Q9NWW5 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLN6Q9NWW5 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLN6Q9NWW5 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLN6Q9NWW5 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLN6Q9NWW5 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CLN6Q9NWW5 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLN6Q9NWW5 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLN6Q9NWW5 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms