Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPR2

SEMA4B, Semaphorin-4B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 832 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4BQ9NPR2 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SEMA4BQ9NPR2 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
SEMA4BQ9NPR2 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SEMA4BQ9NPR2 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SEMA4BQ9NPR2 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SEMA4BQ9NPR2 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
SEMA4BQ9NPR2 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SEMA4BQ9NPR2 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SEMA4BQ9NPR2 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SEMA4BQ9NPR2 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SEMA4BQ9NPR2 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SEMA4BQ9NPR2 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SEMA4BQ9NPR2 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SEMA4BQ9NPR2 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SEMA4BQ9NPR2 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SEMA4BQ9NPR2 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SEMA4BQ9NPR2 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SEMA4BQ9NPR2 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SEMA4BQ9NPR2 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SEMA4BQ9NPR2 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SEMA4BQ9NPR2 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SEMA4BQ9NPR2 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SEMA4BQ9NPR2 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SEMA4BQ9NPR2 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SEMA4BQ9NPR2 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SEMA4BQ9NPR2 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SEMA4BQ9NPR2 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SEMA4BQ9NPR2 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SEMA4BQ9NPR2 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SEMA4BQ9NPR2 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SEMA4BQ9NPR2 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SEMA4BQ9NPR2 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
SEMA4BQ9NPR2 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
SEMA4BQ9NPR2 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SEMA4BQ9NPR2 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
SEMA4BQ9NPR2 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SEMA4BQ9NPR2 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
SEMA4BQ9NPR2 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
SEMA4BQ9NPR2 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SEMA4BQ9NPR2 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
SEMA4BQ9NPR2 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SEMA4BQ9NPR2 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SEMA4BQ9NPR2 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SEMA4BQ9NPR2 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
SEMA4BQ9NPR2 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SEMA4BQ9NPR2 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SEMA4BQ9NPR2 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SEMA4BQ9NPR2 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SEMA4BQ9NPR2 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SEMA4BQ9NPR2 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SEMA4BQ9NPR2 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SEMA4BQ9NPR2 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
SEMA4BQ9NPR2 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SEMA4BQ9NPR2 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SEMA4BQ9NPR2 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SEMA4BQ9NPR2 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SEMA4BQ9NPR2 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SEMA4BQ9NPR2 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SEMA4BQ9NPR2 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SEMA4BQ9NPR2 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SEMA4BQ9NPR2 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SEMA4BQ9NPR2 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SEMA4BQ9NPR2 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SEMA4BQ9NPR2 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
SEMA4BQ9NPR2 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SEMA4BQ9NPR2 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
SEMA4BQ9NPR2 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SEMA4BQ9NPR2 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SEMA4BQ9NPR2 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SEMA4BQ9NPR2 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SEMA4BQ9NPR2 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SEMA4BQ9NPR2 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SEMA4BQ9NPR2 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SEMA4BQ9NPR2 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SEMA4BQ9NPR2 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SEMA4BQ9NPR2 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SEMA4BQ9NPR2 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SEMA4BQ9NPR2 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SEMA4BQ9NPR2 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SEMA4BQ9NPR2 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SEMA4BQ9NPR2 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SEMA4BQ9NPR2 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SEMA4BQ9NPR2 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SEMA4BQ9NPR2 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SEMA4BQ9NPR2 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SEMA4BQ9NPR2 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SEMA4BQ9NPR2 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SEMA4BQ9NPR2 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SEMA4BQ9NPR2 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SEMA4BQ9NPR2 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SEMA4BQ9NPR2 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SEMA4BQ9NPR2 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SEMA4BQ9NPR2 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SEMA4BQ9NPR2 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SEMA4BQ9NPR2 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SEMA4BQ9NPR2 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SEMA4BQ9NPR2 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SEMA4BQ9NPR2 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SEMA4BQ9NPR2 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SEMA4BQ9NPR2 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms