Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPI8

FANCF, Fanconi anemia group F protein, humanhuman

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Length 374 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCFQ9NPI8 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FANCFQ9NPI8 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FANCFQ9NPI8 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FANCFQ9NPI8 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FANCFQ9NPI8 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FANCFQ9NPI8 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FANCFQ9NPI8 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FANCFQ9NPI8 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FANCFQ9NPI8 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FANCFQ9NPI8 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FANCFQ9NPI8 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FANCFQ9NPI8 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FANCFQ9NPI8 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FANCFQ9NPI8 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FANCFQ9NPI8 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FANCFQ9NPI8 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FANCFQ9NPI8 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FANCFQ9NPI8 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FANCFQ9NPI8 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FANCFQ9NPI8 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FANCFQ9NPI8 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FANCFQ9NPI8 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FANCFQ9NPI8 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FANCFQ9NPI8 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FANCFQ9NPI8 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FANCFQ9NPI8 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FANCFQ9NPI8 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FANCFQ9NPI8 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FANCFQ9NPI8 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FANCFQ9NPI8 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FANCFQ9NPI8 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FANCFQ9NPI8 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FANCFQ9NPI8 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FANCFQ9NPI8 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FANCFQ9NPI8 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FANCFQ9NPI8 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FANCFQ9NPI8 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FANCFQ9NPI8 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
FANCFQ9NPI8 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FANCFQ9NPI8 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
FANCFQ9NPI8 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FANCFQ9NPI8 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FANCFQ9NPI8 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FANCFQ9NPI8 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FANCFQ9NPI8 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FANCFQ9NPI8 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FANCFQ9NPI8 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FANCFQ9NPI8 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FANCFQ9NPI8 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FANCFQ9NPI8 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FANCFQ9NPI8 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FANCFQ9NPI8 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FANCFQ9NPI8 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FANCFQ9NPI8 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FANCFQ9NPI8 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FANCFQ9NPI8 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FANCFQ9NPI8 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FANCFQ9NPI8 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FANCFQ9NPI8 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FANCFQ9NPI8 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FANCFQ9NPI8 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FANCFQ9NPI8 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FANCFQ9NPI8 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FANCFQ9NPI8 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FANCFQ9NPI8 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FANCFQ9NPI8 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FANCFQ9NPI8 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FANCFQ9NPI8 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FANCFQ9NPI8 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FANCFQ9NPI8 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FANCFQ9NPI8 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FANCFQ9NPI8 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FANCFQ9NPI8 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
FANCFQ9NPI8 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FANCFQ9NPI8 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FANCFQ9NPI8 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FANCFQ9NPI8 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FANCFQ9NPI8 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
FANCFQ9NPI8 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FANCFQ9NPI8 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FANCFQ9NPI8 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FANCFQ9NPI8 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FANCFQ9NPI8 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FANCFQ9NPI8 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FANCFQ9NPI8 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FANCFQ9NPI8 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FANCFQ9NPI8 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FANCFQ9NPI8 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FANCFQ9NPI8 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FANCFQ9NPI8 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FANCFQ9NPI8 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FANCFQ9NPI8 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FANCFQ9NPI8 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FANCFQ9NPI8 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FANCFQ9NPI8 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FANCFQ9NPI8 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FANCFQ9NPI8 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FANCFQ9NPI8 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
FANCFQ9NPI8 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FANCFQ9NPI8 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
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