Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP90

RAB9B, Ras-related protein Rab-9B, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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RAB9BQ9NP90 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
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RAB9BQ9NP90 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RAB9BQ9NP90 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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RAB9BQ9NP90 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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RAB9BQ9NP90 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RAB9BQ9NP90 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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RAB9BQ9NP90 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
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RAB9BQ9NP90 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
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RAB9BQ9NP90 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
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RAB9BQ9NP90 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
RAB9BQ9NP90 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
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RAB9BQ9NP90 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
RAB9BQ9NP90 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
RAB9BQ9NP90 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
RAB9BQ9NP90 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
RAB9BQ9NP90 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
RAB9BQ9NP90 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
RAB9BQ9NP90 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
RAB9BQ9NP90 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC14.45□□□□□ -0.1
RAB9BQ9NP90 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
RAB9BQ9NP90 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
RAB9BQ9NP90 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
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