Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZT3

SLIRP, SRA stem-loop-interacting RNA-binding protein, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLIRPQ9GZT3 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLIRPQ9GZT3 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLIRPQ9GZT3 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLIRPQ9GZT3 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLIRPQ9GZT3 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLIRPQ9GZT3 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLIRPQ9GZT3 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLIRPQ9GZT3 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLIRPQ9GZT3 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLIRPQ9GZT3 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLIRPQ9GZT3 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLIRPQ9GZT3 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLIRPQ9GZT3 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLIRPQ9GZT3 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLIRPQ9GZT3 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLIRPQ9GZT3 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLIRPQ9GZT3 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLIRPQ9GZT3 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLIRPQ9GZT3 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLIRPQ9GZT3 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLIRPQ9GZT3 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLIRPQ9GZT3 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLIRPQ9GZT3 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLIRPQ9GZT3 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SLIRPQ9GZT3 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLIRPQ9GZT3 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLIRPQ9GZT3 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLIRPQ9GZT3 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SLIRPQ9GZT3 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLIRPQ9GZT3 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLIRPQ9GZT3 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLIRPQ9GZT3 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLIRPQ9GZT3 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLIRPQ9GZT3 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLIRPQ9GZT3 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLIRPQ9GZT3 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLIRPQ9GZT3 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLIRPQ9GZT3 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLIRPQ9GZT3 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLIRPQ9GZT3 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLIRPQ9GZT3 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLIRPQ9GZT3 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLIRPQ9GZT3 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLIRPQ9GZT3 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLIRPQ9GZT3 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLIRPQ9GZT3 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLIRPQ9GZT3 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLIRPQ9GZT3 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLIRPQ9GZT3 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLIRPQ9GZT3 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLIRPQ9GZT3 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLIRPQ9GZT3 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLIRPQ9GZT3 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLIRPQ9GZT3 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLIRPQ9GZT3 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLIRPQ9GZT3 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLIRPQ9GZT3 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLIRPQ9GZT3 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLIRPQ9GZT3 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLIRPQ9GZT3 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLIRPQ9GZT3 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLIRPQ9GZT3 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLIRPQ9GZT3 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLIRPQ9GZT3 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLIRPQ9GZT3 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLIRPQ9GZT3 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SLIRPQ9GZT3 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLIRPQ9GZT3 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SLIRPQ9GZT3 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLIRPQ9GZT3 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLIRPQ9GZT3 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLIRPQ9GZT3 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLIRPQ9GZT3 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLIRPQ9GZT3 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLIRPQ9GZT3 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLIRPQ9GZT3 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLIRPQ9GZT3 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLIRPQ9GZT3 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLIRPQ9GZT3 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLIRPQ9GZT3 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLIRPQ9GZT3 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLIRPQ9GZT3 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLIRPQ9GZT3 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLIRPQ9GZT3 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLIRPQ9GZT3 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLIRPQ9GZT3 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLIRPQ9GZT3 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLIRPQ9GZT3 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLIRPQ9GZT3 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLIRPQ9GZT3 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLIRPQ9GZT3 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLIRPQ9GZT3 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLIRPQ9GZT3 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SLIRPQ9GZT3 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
SLIRPQ9GZT3 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SLIRPQ9GZT3 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SLIRPQ9GZT3 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SLIRPQ9GZT3 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SLIRPQ9GZT3 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SLIRPQ9GZT3 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms