Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZM3

POLR2J2, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB11-b1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2J2Q9GZM3 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
POLR2J2Q9GZM3 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
POLR2J2Q9GZM3 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
POLR2J2Q9GZM3 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
POLR2J2Q9GZM3 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
POLR2J2Q9GZM3 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
POLR2J2Q9GZM3 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
POLR2J2Q9GZM3 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
POLR2J2Q9GZM3 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
POLR2J2Q9GZM3 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
POLR2J2Q9GZM3 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
POLR2J2Q9GZM3 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
POLR2J2Q9GZM3 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
POLR2J2Q9GZM3 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
POLR2J2Q9GZM3 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
POLR2J2Q9GZM3 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
POLR2J2Q9GZM3 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
POLR2J2Q9GZM3 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
POLR2J2Q9GZM3 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
POLR2J2Q9GZM3 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
POLR2J2Q9GZM3 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
POLR2J2Q9GZM3 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
POLR2J2Q9GZM3 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
POLR2J2Q9GZM3 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
POLR2J2Q9GZM3 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
POLR2J2Q9GZM3 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
POLR2J2Q9GZM3 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
POLR2J2Q9GZM3 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
POLR2J2Q9GZM3 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
POLR2J2Q9GZM3 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
POLR2J2Q9GZM3 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
POLR2J2Q9GZM3 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
POLR2J2Q9GZM3 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
POLR2J2Q9GZM3 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
POLR2J2Q9GZM3 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
POLR2J2Q9GZM3 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
POLR2J2Q9GZM3 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
POLR2J2Q9GZM3 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
POLR2J2Q9GZM3 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
POLR2J2Q9GZM3 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
POLR2J2Q9GZM3 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
POLR2J2Q9GZM3 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
POLR2J2Q9GZM3 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
POLR2J2Q9GZM3 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
POLR2J2Q9GZM3 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
POLR2J2Q9GZM3 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
POLR2J2Q9GZM3 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
POLR2J2Q9GZM3 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
POLR2J2Q9GZM3 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
POLR2J2Q9GZM3 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
POLR2J2Q9GZM3 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
POLR2J2Q9GZM3 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
POLR2J2Q9GZM3 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
POLR2J2Q9GZM3 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
POLR2J2Q9GZM3 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
POLR2J2Q9GZM3 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
POLR2J2Q9GZM3 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
POLR2J2Q9GZM3 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
POLR2J2Q9GZM3 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
POLR2J2Q9GZM3 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
POLR2J2Q9GZM3 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
POLR2J2Q9GZM3 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
POLR2J2Q9GZM3 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
POLR2J2Q9GZM3 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
POLR2J2Q9GZM3 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
POLR2J2Q9GZM3 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
POLR2J2Q9GZM3 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
POLR2J2Q9GZM3 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
POLR2J2Q9GZM3 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
POLR2J2Q9GZM3 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
POLR2J2Q9GZM3 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
POLR2J2Q9GZM3 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
POLR2J2Q9GZM3 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
POLR2J2Q9GZM3 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
POLR2J2Q9GZM3 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
POLR2J2Q9GZM3 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
POLR2J2Q9GZM3 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
POLR2J2Q9GZM3 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
POLR2J2Q9GZM3 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
POLR2J2Q9GZM3 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
POLR2J2Q9GZM3 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
POLR2J2Q9GZM3 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
POLR2J2Q9GZM3 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
POLR2J2Q9GZM3 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
POLR2J2Q9GZM3 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
POLR2J2Q9GZM3 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
POLR2J2Q9GZM3 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
POLR2J2Q9GZM3 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
POLR2J2Q9GZM3 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
POLR2J2Q9GZM3 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
POLR2J2Q9GZM3 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
POLR2J2Q9GZM3 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
POLR2J2Q9GZM3 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
POLR2J2Q9GZM3 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
POLR2J2Q9GZM3 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
POLR2J2Q9GZM3 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
POLR2J2Q9GZM3 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
POLR2J2Q9GZM3 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
POLR2J2Q9GZM3 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
POLR2J2Q9GZM3 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.4 ms