Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY41

HDAC8, Histone deacetylase 8, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC8Q9BY41 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HDAC8Q9BY41 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HDAC8Q9BY41 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HDAC8Q9BY41 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HDAC8Q9BY41 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HDAC8Q9BY41 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HDAC8Q9BY41 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HDAC8Q9BY41 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HDAC8Q9BY41 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HDAC8Q9BY41 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HDAC8Q9BY41 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HDAC8Q9BY41 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HDAC8Q9BY41 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HDAC8Q9BY41 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HDAC8Q9BY41 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HDAC8Q9BY41 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HDAC8Q9BY41 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HDAC8Q9BY41 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
HDAC8Q9BY41 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HDAC8Q9BY41 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HDAC8Q9BY41 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HDAC8Q9BY41 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
HDAC8Q9BY41 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HDAC8Q9BY41 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
HDAC8Q9BY41 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
HDAC8Q9BY41 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HDAC8Q9BY41 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HDAC8Q9BY41 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HDAC8Q9BY41 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HDAC8Q9BY41 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HDAC8Q9BY41 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HDAC8Q9BY41 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HDAC8Q9BY41 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HDAC8Q9BY41 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HDAC8Q9BY41 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HDAC8Q9BY41 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HDAC8Q9BY41 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HDAC8Q9BY41 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HDAC8Q9BY41 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HDAC8Q9BY41 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HDAC8Q9BY41 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HDAC8Q9BY41 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HDAC8Q9BY41 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HDAC8Q9BY41 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HDAC8Q9BY41 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HDAC8Q9BY41 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HDAC8Q9BY41 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HDAC8Q9BY41 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HDAC8Q9BY41 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HDAC8Q9BY41 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HDAC8Q9BY41 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HDAC8Q9BY41 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
HDAC8Q9BY41 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HDAC8Q9BY41 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HDAC8Q9BY41 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HDAC8Q9BY41 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
HDAC8Q9BY41 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HDAC8Q9BY41 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HDAC8Q9BY41 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HDAC8Q9BY41 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HDAC8Q9BY41 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
HDAC8Q9BY41 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HDAC8Q9BY41 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HDAC8Q9BY41 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HDAC8Q9BY41 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
HDAC8Q9BY41 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HDAC8Q9BY41 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HDAC8Q9BY41 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HDAC8Q9BY41 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HDAC8Q9BY41 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HDAC8Q9BY41 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HDAC8Q9BY41 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HDAC8Q9BY41 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HDAC8Q9BY41 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HDAC8Q9BY41 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HDAC8Q9BY41 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HDAC8Q9BY41 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HDAC8Q9BY41 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HDAC8Q9BY41 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HDAC8Q9BY41 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HDAC8Q9BY41 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HDAC8Q9BY41 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HDAC8Q9BY41 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HDAC8Q9BY41 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HDAC8Q9BY41 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HDAC8Q9BY41 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HDAC8Q9BY41 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HDAC8Q9BY41 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HDAC8Q9BY41 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HDAC8Q9BY41 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HDAC8Q9BY41 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HDAC8Q9BY41 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HDAC8Q9BY41 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HDAC8Q9BY41 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HDAC8Q9BY41 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
HDAC8Q9BY41 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HDAC8Q9BY41 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HDAC8Q9BY41 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HDAC8Q9BY41 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HDAC8Q9BY41 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms