Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVL2

NUP58, Nucleoporin p58/p45, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP58Q9BVL2 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NUP58Q9BVL2 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NUP58Q9BVL2 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NUP58Q9BVL2 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NUP58Q9BVL2 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NUP58Q9BVL2 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NUP58Q9BVL2 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NUP58Q9BVL2 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NUP58Q9BVL2 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NUP58Q9BVL2 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NUP58Q9BVL2 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NUP58Q9BVL2 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NUP58Q9BVL2 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NUP58Q9BVL2 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NUP58Q9BVL2 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NUP58Q9BVL2 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NUP58Q9BVL2 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NUP58Q9BVL2 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
NUP58Q9BVL2 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NUP58Q9BVL2 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NUP58Q9BVL2 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NUP58Q9BVL2 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NUP58Q9BVL2 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
NUP58Q9BVL2 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NUP58Q9BVL2 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NUP58Q9BVL2 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NUP58Q9BVL2 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
NUP58Q9BVL2 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NUP58Q9BVL2 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NUP58Q9BVL2 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
NUP58Q9BVL2 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NUP58Q9BVL2 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NUP58Q9BVL2 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NUP58Q9BVL2 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NUP58Q9BVL2 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NUP58Q9BVL2 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NUP58Q9BVL2 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NUP58Q9BVL2 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NUP58Q9BVL2 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NUP58Q9BVL2 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NUP58Q9BVL2 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NUP58Q9BVL2 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NUP58Q9BVL2 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NUP58Q9BVL2 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NUP58Q9BVL2 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NUP58Q9BVL2 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NUP58Q9BVL2 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
NUP58Q9BVL2 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NUP58Q9BVL2 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NUP58Q9BVL2 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NUP58Q9BVL2 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NUP58Q9BVL2 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NUP58Q9BVL2 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
NUP58Q9BVL2 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NUP58Q9BVL2 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NUP58Q9BVL2 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NUP58Q9BVL2 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NUP58Q9BVL2 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NUP58Q9BVL2 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
NUP58Q9BVL2 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
NUP58Q9BVL2 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NUP58Q9BVL2 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NUP58Q9BVL2 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
NUP58Q9BVL2 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NUP58Q9BVL2 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NUP58Q9BVL2 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NUP58Q9BVL2 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NUP58Q9BVL2 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NUP58Q9BVL2 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NUP58Q9BVL2 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NUP58Q9BVL2 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NUP58Q9BVL2 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NUP58Q9BVL2 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NUP58Q9BVL2 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NUP58Q9BVL2 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NUP58Q9BVL2 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NUP58Q9BVL2 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NUP58Q9BVL2 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NUP58Q9BVL2 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
NUP58Q9BVL2 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NUP58Q9BVL2 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NUP58Q9BVL2 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NUP58Q9BVL2 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NUP58Q9BVL2 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NUP58Q9BVL2 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NUP58Q9BVL2 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NUP58Q9BVL2 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NUP58Q9BVL2 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NUP58Q9BVL2 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NUP58Q9BVL2 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NUP58Q9BVL2 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
NUP58Q9BVL2 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
NUP58Q9BVL2 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
NUP58Q9BVL2 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NUP58Q9BVL2 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NUP58Q9BVL2 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NUP58Q9BVL2 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NUP58Q9BVL2 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NUP58Q9BVL2 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NUP58Q9BVL2 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms