Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSE4

HERPUD2, Homocysteine-responsive endoplasmic reticulum-resident ubiquitin-like domain member 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERPUD2Q9BSE4 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HERPUD2Q9BSE4 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
HERPUD2Q9BSE4 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HERPUD2Q9BSE4 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HERPUD2Q9BSE4 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
HERPUD2Q9BSE4 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HERPUD2Q9BSE4 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
HERPUD2Q9BSE4 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
HERPUD2Q9BSE4 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
HERPUD2Q9BSE4 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HERPUD2Q9BSE4 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC18■□□□□ 0.47
HERPUD2Q9BSE4 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
HERPUD2Q9BSE4 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HERPUD2Q9BSE4 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
HERPUD2Q9BSE4 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
HERPUD2Q9BSE4 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
HERPUD2Q9BSE4 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
HERPUD2Q9BSE4 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
HERPUD2Q9BSE4 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
HERPUD2Q9BSE4 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
HERPUD2Q9BSE4 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
HERPUD2Q9BSE4 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HERPUD2Q9BSE4 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
HERPUD2Q9BSE4 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
HERPUD2Q9BSE4 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
HERPUD2Q9BSE4 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HERPUD2Q9BSE4 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
HERPUD2Q9BSE4 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
HERPUD2Q9BSE4 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HERPUD2Q9BSE4 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
HERPUD2Q9BSE4 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HERPUD2Q9BSE4 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HERPUD2Q9BSE4 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HERPUD2Q9BSE4 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HERPUD2Q9BSE4 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HERPUD2Q9BSE4 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HERPUD2Q9BSE4 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HERPUD2Q9BSE4 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HERPUD2Q9BSE4 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HERPUD2Q9BSE4 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HERPUD2Q9BSE4 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
HERPUD2Q9BSE4 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HERPUD2Q9BSE4 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HERPUD2Q9BSE4 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HERPUD2Q9BSE4 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
HERPUD2Q9BSE4 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
HERPUD2Q9BSE4 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HERPUD2Q9BSE4 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HERPUD2Q9BSE4 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HERPUD2Q9BSE4 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HERPUD2Q9BSE4 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HERPUD2Q9BSE4 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HERPUD2Q9BSE4 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HERPUD2Q9BSE4 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HERPUD2Q9BSE4 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HERPUD2Q9BSE4 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HERPUD2Q9BSE4 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HERPUD2Q9BSE4 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HERPUD2Q9BSE4 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HERPUD2Q9BSE4 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HERPUD2Q9BSE4 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HERPUD2Q9BSE4 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HERPUD2Q9BSE4 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HERPUD2Q9BSE4 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HERPUD2Q9BSE4 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HERPUD2Q9BSE4 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HERPUD2Q9BSE4 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HERPUD2Q9BSE4 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HERPUD2Q9BSE4 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
HERPUD2Q9BSE4 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HERPUD2Q9BSE4 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HERPUD2Q9BSE4 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HERPUD2Q9BSE4 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
HERPUD2Q9BSE4 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
HERPUD2Q9BSE4 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HERPUD2Q9BSE4 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HERPUD2Q9BSE4 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
HERPUD2Q9BSE4 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HERPUD2Q9BSE4 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
HERPUD2Q9BSE4 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HERPUD2Q9BSE4 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HERPUD2Q9BSE4 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HERPUD2Q9BSE4 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HERPUD2Q9BSE4 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HERPUD2Q9BSE4 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HERPUD2Q9BSE4 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HERPUD2Q9BSE4 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HERPUD2Q9BSE4 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HERPUD2Q9BSE4 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HERPUD2Q9BSE4 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HERPUD2Q9BSE4 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HERPUD2Q9BSE4 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HERPUD2Q9BSE4 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HERPUD2Q9BSE4 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HERPUD2Q9BSE4 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HERPUD2Q9BSE4 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HERPUD2Q9BSE4 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HERPUD2Q9BSE4 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HERPUD2Q9BSE4 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HERPUD2Q9BSE4 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms