Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQD1

PMCHL2, Putative pro-MCH-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 86 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMCHL2Q9BQD1 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
PMCHL2Q9BQD1 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
PMCHL2Q9BQD1 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
PMCHL2Q9BQD1 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
PMCHL2Q9BQD1 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
PMCHL2Q9BQD1 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
PMCHL2Q9BQD1 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
PMCHL2Q9BQD1 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
PMCHL2Q9BQD1 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
PMCHL2Q9BQD1 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
PMCHL2Q9BQD1 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
PMCHL2Q9BQD1 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
PMCHL2Q9BQD1 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
PMCHL2Q9BQD1 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
PMCHL2Q9BQD1 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
PMCHL2Q9BQD1 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
PMCHL2Q9BQD1 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PMCHL2Q9BQD1 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PMCHL2Q9BQD1 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
PMCHL2Q9BQD1 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
PMCHL2Q9BQD1 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PMCHL2Q9BQD1 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
PMCHL2Q9BQD1 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
PMCHL2Q9BQD1 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PMCHL2Q9BQD1 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
PMCHL2Q9BQD1 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PMCHL2Q9BQD1 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PMCHL2Q9BQD1 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PMCHL2Q9BQD1 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
PMCHL2Q9BQD1 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
PMCHL2Q9BQD1 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
PMCHL2Q9BQD1 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
PMCHL2Q9BQD1 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PMCHL2Q9BQD1 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
PMCHL2Q9BQD1 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PMCHL2Q9BQD1 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PMCHL2Q9BQD1 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PMCHL2Q9BQD1 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PMCHL2Q9BQD1 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PMCHL2Q9BQD1 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
PMCHL2Q9BQD1 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PMCHL2Q9BQD1 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
PMCHL2Q9BQD1 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
PMCHL2Q9BQD1 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
PMCHL2Q9BQD1 ABCA7-201ENST00000263094 6816 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
PMCHL2Q9BQD1 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PMCHL2Q9BQD1 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
PMCHL2Q9BQD1 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PMCHL2Q9BQD1 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PMCHL2Q9BQD1 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PMCHL2Q9BQD1 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
PMCHL2Q9BQD1 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
PMCHL2Q9BQD1 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PMCHL2Q9BQD1 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PMCHL2Q9BQD1 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
PMCHL2Q9BQD1 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PMCHL2Q9BQD1 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
PMCHL2Q9BQD1 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PMCHL2Q9BQD1 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PMCHL2Q9BQD1 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PMCHL2Q9BQD1 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
PMCHL2Q9BQD1 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
PMCHL2Q9BQD1 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PMCHL2Q9BQD1 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
PMCHL2Q9BQD1 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
PMCHL2Q9BQD1 SIDT1-201ENST00000264852 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.39
PMCHL2Q9BQD1 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
PMCHL2Q9BQD1 GTF2I-212ENST00000573035 4548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
PMCHL2Q9BQD1 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
PMCHL2Q9BQD1 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
PMCHL2Q9BQD1 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
PMCHL2Q9BQD1 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
PMCHL2Q9BQD1 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
PMCHL2Q9BQD1 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
PMCHL2Q9BQD1 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
PMCHL2Q9BQD1 TRPM1-203ENST00000542188 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
PMCHL2Q9BQD1 RUNX1T1-251ENST00000615601 7372 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
PMCHL2Q9BQD1 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
PMCHL2Q9BQD1 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
PMCHL2Q9BQD1 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
PMCHL2Q9BQD1 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
PMCHL2Q9BQD1 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
PMCHL2Q9BQD1 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
PMCHL2Q9BQD1 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
PMCHL2Q9BQD1 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
PMCHL2Q9BQD1 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
PMCHL2Q9BQD1 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
PMCHL2Q9BQD1 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
PMCHL2Q9BQD1 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
PMCHL2Q9BQD1 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
PMCHL2Q9BQD1 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
PMCHL2Q9BQD1 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
PMCHL2Q9BQD1 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
PMCHL2Q9BQD1 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
PMCHL2Q9BQD1 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
PMCHL2Q9BQD1 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
PMCHL2Q9BQD1 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
PMCHL2Q9BQD1 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
PMCHL2Q9BQD1 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
PMCHL2Q9BQD1 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms