Protein–RNA interactions for Protein: Q99536

VAT1, Synaptic vesicle membrane protein VAT-1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAT1Q99536 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
VAT1Q99536 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
VAT1Q99536 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
VAT1Q99536 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
VAT1Q99536 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
VAT1Q99536 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
VAT1Q99536 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
VAT1Q99536 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
VAT1Q99536 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
VAT1Q99536 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
VAT1Q99536 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
VAT1Q99536 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
VAT1Q99536 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
VAT1Q99536 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
VAT1Q99536 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
VAT1Q99536 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
VAT1Q99536 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
VAT1Q99536 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
VAT1Q99536 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
VAT1Q99536 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
VAT1Q99536 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
VAT1Q99536 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
VAT1Q99536 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
VAT1Q99536 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
VAT1Q99536 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
VAT1Q99536 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
VAT1Q99536 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
VAT1Q99536 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
VAT1Q99536 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
VAT1Q99536 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
VAT1Q99536 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
VAT1Q99536 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
VAT1Q99536 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
VAT1Q99536 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
VAT1Q99536 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
VAT1Q99536 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
VAT1Q99536 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
VAT1Q99536 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
VAT1Q99536 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
VAT1Q99536 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
VAT1Q99536 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
VAT1Q99536 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
VAT1Q99536 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
VAT1Q99536 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
VAT1Q99536 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
VAT1Q99536 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
VAT1Q99536 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
VAT1Q99536 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
VAT1Q99536 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
VAT1Q99536 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
VAT1Q99536 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
VAT1Q99536 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
VAT1Q99536 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
VAT1Q99536 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
VAT1Q99536 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
VAT1Q99536 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
VAT1Q99536 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
VAT1Q99536 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
VAT1Q99536 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
VAT1Q99536 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
VAT1Q99536 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
VAT1Q99536 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
VAT1Q99536 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
VAT1Q99536 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
VAT1Q99536 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
VAT1Q99536 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
VAT1Q99536 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
VAT1Q99536 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
VAT1Q99536 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
VAT1Q99536 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
VAT1Q99536 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
VAT1Q99536 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
VAT1Q99536 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
VAT1Q99536 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
VAT1Q99536 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
VAT1Q99536 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
VAT1Q99536 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
VAT1Q99536 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
VAT1Q99536 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
VAT1Q99536 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
VAT1Q99536 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
VAT1Q99536 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
VAT1Q99536 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
VAT1Q99536 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
VAT1Q99536 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
VAT1Q99536 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
VAT1Q99536 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
VAT1Q99536 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
VAT1Q99536 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
VAT1Q99536 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
VAT1Q99536 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
VAT1Q99536 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
VAT1Q99536 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
VAT1Q99536 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
VAT1Q99536 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
VAT1Q99536 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
VAT1Q99536 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
VAT1Q99536 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
VAT1Q99536 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
VAT1Q99536 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69 ms