Protein–RNA interactions for Protein: Q99457

NAP1L3, Nucleosome assembly protein 1-like 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAP1L3Q99457 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NAP1L3Q99457 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NAP1L3Q99457 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NAP1L3Q99457 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NAP1L3Q99457 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NAP1L3Q99457 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NAP1L3Q99457 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NAP1L3Q99457 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NAP1L3Q99457 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NAP1L3Q99457 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
NAP1L3Q99457 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
NAP1L3Q99457 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NAP1L3Q99457 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NAP1L3Q99457 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NAP1L3Q99457 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NAP1L3Q99457 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NAP1L3Q99457 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NAP1L3Q99457 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
NAP1L3Q99457 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NAP1L3Q99457 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NAP1L3Q99457 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NAP1L3Q99457 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NAP1L3Q99457 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NAP1L3Q99457 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NAP1L3Q99457 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NAP1L3Q99457 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NAP1L3Q99457 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NAP1L3Q99457 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NAP1L3Q99457 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NAP1L3Q99457 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NAP1L3Q99457 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NAP1L3Q99457 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NAP1L3Q99457 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NAP1L3Q99457 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NAP1L3Q99457 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NAP1L3Q99457 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NAP1L3Q99457 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NAP1L3Q99457 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NAP1L3Q99457 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NAP1L3Q99457 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NAP1L3Q99457 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NAP1L3Q99457 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NAP1L3Q99457 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NAP1L3Q99457 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NAP1L3Q99457 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NAP1L3Q99457 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NAP1L3Q99457 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NAP1L3Q99457 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NAP1L3Q99457 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NAP1L3Q99457 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
NAP1L3Q99457 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NAP1L3Q99457 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NAP1L3Q99457 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NAP1L3Q99457 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NAP1L3Q99457 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
NAP1L3Q99457 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NAP1L3Q99457 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NAP1L3Q99457 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NAP1L3Q99457 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NAP1L3Q99457 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
NAP1L3Q99457 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NAP1L3Q99457 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
NAP1L3Q99457 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NAP1L3Q99457 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NAP1L3Q99457 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NAP1L3Q99457 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NAP1L3Q99457 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
NAP1L3Q99457 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NAP1L3Q99457 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NAP1L3Q99457 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NAP1L3Q99457 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NAP1L3Q99457 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NAP1L3Q99457 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NAP1L3Q99457 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NAP1L3Q99457 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NAP1L3Q99457 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NAP1L3Q99457 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
NAP1L3Q99457 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NAP1L3Q99457 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NAP1L3Q99457 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NAP1L3Q99457 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NAP1L3Q99457 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NAP1L3Q99457 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NAP1L3Q99457 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NAP1L3Q99457 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NAP1L3Q99457 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NAP1L3Q99457 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NAP1L3Q99457 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NAP1L3Q99457 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NAP1L3Q99457 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NAP1L3Q99457 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NAP1L3Q99457 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NAP1L3Q99457 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NAP1L3Q99457 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NAP1L3Q99457 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NAP1L3Q99457 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
NAP1L3Q99457 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NAP1L3Q99457 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NAP1L3Q99457 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
NAP1L3Q99457 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54 ms