Protein–RNA interactions for Protein: Q96FJ0

STAMBPL1, AMSH-like protease, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STAMBPL1Q96FJ0 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
STAMBPL1Q96FJ0 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
STAMBPL1Q96FJ0 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
STAMBPL1Q96FJ0 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
STAMBPL1Q96FJ0 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
STAMBPL1Q96FJ0 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
STAMBPL1Q96FJ0 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
STAMBPL1Q96FJ0 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
STAMBPL1Q96FJ0 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
STAMBPL1Q96FJ0 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
STAMBPL1Q96FJ0 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
STAMBPL1Q96FJ0 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
STAMBPL1Q96FJ0 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
STAMBPL1Q96FJ0 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
STAMBPL1Q96FJ0 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
STAMBPL1Q96FJ0 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
STAMBPL1Q96FJ0 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
STAMBPL1Q96FJ0 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
STAMBPL1Q96FJ0 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
STAMBPL1Q96FJ0 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
STAMBPL1Q96FJ0 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
STAMBPL1Q96FJ0 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
STAMBPL1Q96FJ0 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
STAMBPL1Q96FJ0 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
STAMBPL1Q96FJ0 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
STAMBPL1Q96FJ0 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
STAMBPL1Q96FJ0 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
STAMBPL1Q96FJ0 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
STAMBPL1Q96FJ0 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
STAMBPL1Q96FJ0 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
STAMBPL1Q96FJ0 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
STAMBPL1Q96FJ0 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
STAMBPL1Q96FJ0 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
STAMBPL1Q96FJ0 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
STAMBPL1Q96FJ0 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
STAMBPL1Q96FJ0 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
STAMBPL1Q96FJ0 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
STAMBPL1Q96FJ0 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
STAMBPL1Q96FJ0 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
STAMBPL1Q96FJ0 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
STAMBPL1Q96FJ0 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
STAMBPL1Q96FJ0 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
STAMBPL1Q96FJ0 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
STAMBPL1Q96FJ0 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
STAMBPL1Q96FJ0 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
STAMBPL1Q96FJ0 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
STAMBPL1Q96FJ0 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
STAMBPL1Q96FJ0 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
STAMBPL1Q96FJ0 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
STAMBPL1Q96FJ0 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
STAMBPL1Q96FJ0 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
STAMBPL1Q96FJ0 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
STAMBPL1Q96FJ0 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
STAMBPL1Q96FJ0 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
STAMBPL1Q96FJ0 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
STAMBPL1Q96FJ0 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
STAMBPL1Q96FJ0 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
STAMBPL1Q96FJ0 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
STAMBPL1Q96FJ0 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
STAMBPL1Q96FJ0 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
STAMBPL1Q96FJ0 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
STAMBPL1Q96FJ0 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
STAMBPL1Q96FJ0 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
STAMBPL1Q96FJ0 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
STAMBPL1Q96FJ0 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
STAMBPL1Q96FJ0 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
STAMBPL1Q96FJ0 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
STAMBPL1Q96FJ0 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
STAMBPL1Q96FJ0 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
STAMBPL1Q96FJ0 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
STAMBPL1Q96FJ0 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
STAMBPL1Q96FJ0 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
STAMBPL1Q96FJ0 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
STAMBPL1Q96FJ0 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
STAMBPL1Q96FJ0 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
STAMBPL1Q96FJ0 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
STAMBPL1Q96FJ0 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
STAMBPL1Q96FJ0 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
STAMBPL1Q96FJ0 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
STAMBPL1Q96FJ0 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
STAMBPL1Q96FJ0 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
STAMBPL1Q96FJ0 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
STAMBPL1Q96FJ0 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
STAMBPL1Q96FJ0 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
STAMBPL1Q96FJ0 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
STAMBPL1Q96FJ0 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
STAMBPL1Q96FJ0 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
STAMBPL1Q96FJ0 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
STAMBPL1Q96FJ0 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
STAMBPL1Q96FJ0 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
STAMBPL1Q96FJ0 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
STAMBPL1Q96FJ0 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
STAMBPL1Q96FJ0 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
STAMBPL1Q96FJ0 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
STAMBPL1Q96FJ0 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
STAMBPL1Q96FJ0 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
STAMBPL1Q96FJ0 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
STAMBPL1Q96FJ0 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
STAMBPL1Q96FJ0 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
STAMBPL1Q96FJ0 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.3 ms