Protein–RNA interactions for Protein: Q96D46

NMD3, 60S ribosomal export protein NMD3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMD3Q96D46 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
NMD3Q96D46 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NMD3Q96D46 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NMD3Q96D46 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NMD3Q96D46 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NMD3Q96D46 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NMD3Q96D46 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NMD3Q96D46 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NMD3Q96D46 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NMD3Q96D46 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NMD3Q96D46 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NMD3Q96D46 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NMD3Q96D46 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NMD3Q96D46 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NMD3Q96D46 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NMD3Q96D46 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NMD3Q96D46 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NMD3Q96D46 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NMD3Q96D46 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NMD3Q96D46 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NMD3Q96D46 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NMD3Q96D46 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NMD3Q96D46 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NMD3Q96D46 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NMD3Q96D46 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NMD3Q96D46 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NMD3Q96D46 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NMD3Q96D46 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
NMD3Q96D46 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NMD3Q96D46 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NMD3Q96D46 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NMD3Q96D46 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NMD3Q96D46 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NMD3Q96D46 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
NMD3Q96D46 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NMD3Q96D46 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NMD3Q96D46 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NMD3Q96D46 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NMD3Q96D46 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
NMD3Q96D46 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NMD3Q96D46 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NMD3Q96D46 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NMD3Q96D46 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NMD3Q96D46 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NMD3Q96D46 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NMD3Q96D46 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NMD3Q96D46 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NMD3Q96D46 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NMD3Q96D46 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NMD3Q96D46 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NMD3Q96D46 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NMD3Q96D46 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NMD3Q96D46 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NMD3Q96D46 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NMD3Q96D46 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NMD3Q96D46 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NMD3Q96D46 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NMD3Q96D46 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NMD3Q96D46 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NMD3Q96D46 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NMD3Q96D46 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
NMD3Q96D46 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NMD3Q96D46 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NMD3Q96D46 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
NMD3Q96D46 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NMD3Q96D46 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
NMD3Q96D46 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.23
NMD3Q96D46 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
NMD3Q96D46 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
NMD3Q96D46 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NMD3Q96D46 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NMD3Q96D46 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NMD3Q96D46 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NMD3Q96D46 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NMD3Q96D46 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NMD3Q96D46 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NMD3Q96D46 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NMD3Q96D46 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NMD3Q96D46 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NMD3Q96D46 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NMD3Q96D46 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NMD3Q96D46 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NMD3Q96D46 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NMD3Q96D46 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NMD3Q96D46 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NMD3Q96D46 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NMD3Q96D46 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NMD3Q96D46 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NMD3Q96D46 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NMD3Q96D46 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NMD3Q96D46 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NMD3Q96D46 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NMD3Q96D46 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NMD3Q96D46 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NMD3Q96D46 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NMD3Q96D46 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NMD3Q96D46 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NMD3Q96D46 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NMD3Q96D46 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NMD3Q96D46 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.8 ms