Protein–RNA interactions for Protein: Q93099

HGD, Homogentisate 1,2-dioxygenase, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HGDQ93099 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HGDQ93099 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HGDQ93099 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HGDQ93099 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HGDQ93099 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HGDQ93099 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HGDQ93099 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HGDQ93099 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HGDQ93099 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HGDQ93099 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HGDQ93099 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HGDQ93099 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HGDQ93099 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HGDQ93099 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HGDQ93099 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HGDQ93099 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
HGDQ93099 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HGDQ93099 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HGDQ93099 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
HGDQ93099 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HGDQ93099 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HGDQ93099 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HGDQ93099 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HGDQ93099 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HGDQ93099 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HGDQ93099 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HGDQ93099 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HGDQ93099 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HGDQ93099 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HGDQ93099 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HGDQ93099 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HGDQ93099 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HGDQ93099 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HGDQ93099 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HGDQ93099 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HGDQ93099 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HGDQ93099 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HGDQ93099 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HGDQ93099 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HGDQ93099 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
HGDQ93099 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HGDQ93099 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HGDQ93099 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HGDQ93099 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HGDQ93099 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HGDQ93099 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HGDQ93099 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HGDQ93099 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HGDQ93099 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HGDQ93099 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HGDQ93099 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HGDQ93099 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HGDQ93099 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HGDQ93099 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HGDQ93099 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HGDQ93099 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HGDQ93099 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HGDQ93099 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
HGDQ93099 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HGDQ93099 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HGDQ93099 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
HGDQ93099 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HGDQ93099 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HGDQ93099 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HGDQ93099 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HGDQ93099 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HGDQ93099 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HGDQ93099 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HGDQ93099 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HGDQ93099 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
HGDQ93099 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HGDQ93099 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HGDQ93099 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HGDQ93099 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HGDQ93099 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HGDQ93099 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
HGDQ93099 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HGDQ93099 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HGDQ93099 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HGDQ93099 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
HGDQ93099 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HGDQ93099 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HGDQ93099 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HGDQ93099 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HGDQ93099 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HGDQ93099 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HGDQ93099 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HGDQ93099 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HGDQ93099 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HGDQ93099 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
HGDQ93099 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HGDQ93099 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HGDQ93099 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HGDQ93099 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HGDQ93099 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HGDQ93099 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HGDQ93099 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HGDQ93099 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HGDQ93099 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HGDQ93099 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms