Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUD4

CCDC12, Coiled-coil domain-containing protein 12, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC12Q8WUD4 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC12Q8WUD4 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC12Q8WUD4 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC12Q8WUD4 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC12Q8WUD4 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC12Q8WUD4 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CCDC12Q8WUD4 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CCDC12Q8WUD4 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
CCDC12Q8WUD4 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CCDC12Q8WUD4 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CCDC12Q8WUD4 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CCDC12Q8WUD4 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC12Q8WUD4 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC12Q8WUD4 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC12Q8WUD4 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC12Q8WUD4 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC12Q8WUD4 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC12Q8WUD4 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC12Q8WUD4 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC12Q8WUD4 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC12Q8WUD4 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC12Q8WUD4 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC12Q8WUD4 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC12Q8WUD4 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC12Q8WUD4 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC12Q8WUD4 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC12Q8WUD4 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC12Q8WUD4 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC12Q8WUD4 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC12Q8WUD4 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC12Q8WUD4 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC12Q8WUD4 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC12Q8WUD4 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC12Q8WUD4 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC12Q8WUD4 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC12Q8WUD4 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC12Q8WUD4 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC12Q8WUD4 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC12Q8WUD4 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC12Q8WUD4 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC12Q8WUD4 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC12Q8WUD4 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC12Q8WUD4 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC12Q8WUD4 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC12Q8WUD4 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC12Q8WUD4 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC12Q8WUD4 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC12Q8WUD4 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC12Q8WUD4 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC12Q8WUD4 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC12Q8WUD4 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC12Q8WUD4 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC12Q8WUD4 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC12Q8WUD4 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC12Q8WUD4 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC12Q8WUD4 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC12Q8WUD4 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC12Q8WUD4 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC12Q8WUD4 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC12Q8WUD4 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC12Q8WUD4 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC12Q8WUD4 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC12Q8WUD4 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC12Q8WUD4 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC12Q8WUD4 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC12Q8WUD4 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC12Q8WUD4 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC12Q8WUD4 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC12Q8WUD4 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC12Q8WUD4 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC12Q8WUD4 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC12Q8WUD4 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC12Q8WUD4 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC12Q8WUD4 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC12Q8WUD4 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC12Q8WUD4 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC12Q8WUD4 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC12Q8WUD4 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC12Q8WUD4 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC12Q8WUD4 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC12Q8WUD4 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC12Q8WUD4 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC12Q8WUD4 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC12Q8WUD4 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC12Q8WUD4 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC12Q8WUD4 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC12Q8WUD4 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC12Q8WUD4 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC12Q8WUD4 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC12Q8WUD4 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC12Q8WUD4 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC12Q8WUD4 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC12Q8WUD4 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC12Q8WUD4 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC12Q8WUD4 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC12Q8WUD4 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC12Q8WUD4 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC12Q8WUD4 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC12Q8WUD4 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC12Q8WUD4 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms