Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3Y7

KRT28, Keratin, type I cytoskeletal 28, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT28Q7Z3Y7 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
KRT28Q7Z3Y7 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KRT28Q7Z3Y7 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KRT28Q7Z3Y7 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KRT28Q7Z3Y7 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KRT28Q7Z3Y7 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KRT28Q7Z3Y7 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KRT28Q7Z3Y7 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KRT28Q7Z3Y7 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KRT28Q7Z3Y7 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KRT28Q7Z3Y7 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KRT28Q7Z3Y7 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KRT28Q7Z3Y7 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KRT28Q7Z3Y7 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KRT28Q7Z3Y7 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KRT28Q7Z3Y7 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KRT28Q7Z3Y7 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KRT28Q7Z3Y7 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KRT28Q7Z3Y7 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KRT28Q7Z3Y7 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KRT28Q7Z3Y7 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KRT28Q7Z3Y7 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KRT28Q7Z3Y7 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KRT28Q7Z3Y7 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KRT28Q7Z3Y7 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KRT28Q7Z3Y7 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KRT28Q7Z3Y7 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KRT28Q7Z3Y7 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KRT28Q7Z3Y7 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KRT28Q7Z3Y7 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KRT28Q7Z3Y7 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
KRT28Q7Z3Y7 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KRT28Q7Z3Y7 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KRT28Q7Z3Y7 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KRT28Q7Z3Y7 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KRT28Q7Z3Y7 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KRT28Q7Z3Y7 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KRT28Q7Z3Y7 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KRT28Q7Z3Y7 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
KRT28Q7Z3Y7 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KRT28Q7Z3Y7 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KRT28Q7Z3Y7 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KRT28Q7Z3Y7 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KRT28Q7Z3Y7 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KRT28Q7Z3Y7 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
KRT28Q7Z3Y7 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KRT28Q7Z3Y7 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
KRT28Q7Z3Y7 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KRT28Q7Z3Y7 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KRT28Q7Z3Y7 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
KRT28Q7Z3Y7 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KRT28Q7Z3Y7 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KRT28Q7Z3Y7 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KRT28Q7Z3Y7 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KRT28Q7Z3Y7 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KRT28Q7Z3Y7 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KRT28Q7Z3Y7 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KRT28Q7Z3Y7 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KRT28Q7Z3Y7 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KRT28Q7Z3Y7 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KRT28Q7Z3Y7 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KRT28Q7Z3Y7 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KRT28Q7Z3Y7 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
KRT28Q7Z3Y7 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KRT28Q7Z3Y7 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KRT28Q7Z3Y7 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KRT28Q7Z3Y7 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KRT28Q7Z3Y7 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KRT28Q7Z3Y7 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KRT28Q7Z3Y7 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KRT28Q7Z3Y7 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KRT28Q7Z3Y7 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KRT28Q7Z3Y7 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KRT28Q7Z3Y7 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KRT28Q7Z3Y7 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KRT28Q7Z3Y7 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KRT28Q7Z3Y7 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KRT28Q7Z3Y7 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KRT28Q7Z3Y7 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
KRT28Q7Z3Y7 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
KRT28Q7Z3Y7 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
KRT28Q7Z3Y7 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KRT28Q7Z3Y7 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KRT28Q7Z3Y7 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KRT28Q7Z3Y7 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KRT28Q7Z3Y7 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KRT28Q7Z3Y7 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KRT28Q7Z3Y7 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KRT28Q7Z3Y7 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KRT28Q7Z3Y7 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KRT28Q7Z3Y7 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KRT28Q7Z3Y7 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KRT28Q7Z3Y7 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
KRT28Q7Z3Y7 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
KRT28Q7Z3Y7 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KRT28Q7Z3Y7 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KRT28Q7Z3Y7 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KRT28Q7Z3Y7 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KRT28Q7Z3Y7 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KRT28Q7Z3Y7 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms