Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWL2

SUSD1, Sushi domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUSD1Q6UWL2 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SUSD1Q6UWL2 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SUSD1Q6UWL2 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SUSD1Q6UWL2 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SUSD1Q6UWL2 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SUSD1Q6UWL2 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SUSD1Q6UWL2 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
SUSD1Q6UWL2 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SUSD1Q6UWL2 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SUSD1Q6UWL2 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SUSD1Q6UWL2 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SUSD1Q6UWL2 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SUSD1Q6UWL2 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SUSD1Q6UWL2 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SUSD1Q6UWL2 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SUSD1Q6UWL2 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SUSD1Q6UWL2 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SUSD1Q6UWL2 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SUSD1Q6UWL2 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SUSD1Q6UWL2 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SUSD1Q6UWL2 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SUSD1Q6UWL2 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
SUSD1Q6UWL2 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
SUSD1Q6UWL2 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SUSD1Q6UWL2 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SUSD1Q6UWL2 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SUSD1Q6UWL2 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SUSD1Q6UWL2 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SUSD1Q6UWL2 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SUSD1Q6UWL2 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SUSD1Q6UWL2 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SUSD1Q6UWL2 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SUSD1Q6UWL2 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SUSD1Q6UWL2 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.3
SUSD1Q6UWL2 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
SUSD1Q6UWL2 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
SUSD1Q6UWL2 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
SUSD1Q6UWL2 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
SUSD1Q6UWL2 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SUSD1Q6UWL2 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SUSD1Q6UWL2 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SUSD1Q6UWL2 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SUSD1Q6UWL2 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SUSD1Q6UWL2 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SUSD1Q6UWL2 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SUSD1Q6UWL2 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SUSD1Q6UWL2 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SUSD1Q6UWL2 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SUSD1Q6UWL2 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SUSD1Q6UWL2 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SUSD1Q6UWL2 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SUSD1Q6UWL2 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SUSD1Q6UWL2 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SUSD1Q6UWL2 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SUSD1Q6UWL2 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SUSD1Q6UWL2 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SUSD1Q6UWL2 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SUSD1Q6UWL2 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SUSD1Q6UWL2 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SUSD1Q6UWL2 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SUSD1Q6UWL2 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
SUSD1Q6UWL2 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SUSD1Q6UWL2 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SUSD1Q6UWL2 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SUSD1Q6UWL2 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SUSD1Q6UWL2 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SUSD1Q6UWL2 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SUSD1Q6UWL2 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SUSD1Q6UWL2 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SUSD1Q6UWL2 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SUSD1Q6UWL2 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SUSD1Q6UWL2 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SUSD1Q6UWL2 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SUSD1Q6UWL2 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SUSD1Q6UWL2 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SUSD1Q6UWL2 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SUSD1Q6UWL2 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SUSD1Q6UWL2 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SUSD1Q6UWL2 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SUSD1Q6UWL2 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SUSD1Q6UWL2 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SUSD1Q6UWL2 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SUSD1Q6UWL2 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SUSD1Q6UWL2 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SUSD1Q6UWL2 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
SUSD1Q6UWL2 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SUSD1Q6UWL2 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SUSD1Q6UWL2 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SUSD1Q6UWL2 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SUSD1Q6UWL2 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SUSD1Q6UWL2 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SUSD1Q6UWL2 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SUSD1Q6UWL2 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SUSD1Q6UWL2 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SUSD1Q6UWL2 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SUSD1Q6UWL2 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SUSD1Q6UWL2 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SUSD1Q6UWL2 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SUSD1Q6UWL2 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SUSD1Q6UWL2 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms