Protein–RNA interactions for Protein: Q5VUD6

FAM69B, Protein FAM69B, humanhuman

Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM69BQ5VUD6 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FAM69BQ5VUD6 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FAM69BQ5VUD6 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FAM69BQ5VUD6 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FAM69BQ5VUD6 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FAM69BQ5VUD6 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FAM69BQ5VUD6 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FAM69BQ5VUD6 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FAM69BQ5VUD6 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FAM69BQ5VUD6 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FAM69BQ5VUD6 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FAM69BQ5VUD6 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
FAM69BQ5VUD6 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FAM69BQ5VUD6 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FAM69BQ5VUD6 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FAM69BQ5VUD6 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FAM69BQ5VUD6 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FAM69BQ5VUD6 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FAM69BQ5VUD6 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FAM69BQ5VUD6 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FAM69BQ5VUD6 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FAM69BQ5VUD6 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
FAM69BQ5VUD6 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FAM69BQ5VUD6 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FAM69BQ5VUD6 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FAM69BQ5VUD6 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FAM69BQ5VUD6 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FAM69BQ5VUD6 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
FAM69BQ5VUD6 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
FAM69BQ5VUD6 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
FAM69BQ5VUD6 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
FAM69BQ5VUD6 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
FAM69BQ5VUD6 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
FAM69BQ5VUD6 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
FAM69BQ5VUD6 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
FAM69BQ5VUD6 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
FAM69BQ5VUD6 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
FAM69BQ5VUD6 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
FAM69BQ5VUD6 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
FAM69BQ5VUD6 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
FAM69BQ5VUD6 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
FAM69BQ5VUD6 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
FAM69BQ5VUD6 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
FAM69BQ5VUD6 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
FAM69BQ5VUD6 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
FAM69BQ5VUD6 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
FAM69BQ5VUD6 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
FAM69BQ5VUD6 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
FAM69BQ5VUD6 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
FAM69BQ5VUD6 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
FAM69BQ5VUD6 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
FAM69BQ5VUD6 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
FAM69BQ5VUD6 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
FAM69BQ5VUD6 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
FAM69BQ5VUD6 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
FAM69BQ5VUD6 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
FAM69BQ5VUD6 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
FAM69BQ5VUD6 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
FAM69BQ5VUD6 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
FAM69BQ5VUD6 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
FAM69BQ5VUD6 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
FAM69BQ5VUD6 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
FAM69BQ5VUD6 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
FAM69BQ5VUD6 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
FAM69BQ5VUD6 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
FAM69BQ5VUD6 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
FAM69BQ5VUD6 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
FAM69BQ5VUD6 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
FAM69BQ5VUD6 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
FAM69BQ5VUD6 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
FAM69BQ5VUD6 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
FAM69BQ5VUD6 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
FAM69BQ5VUD6 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
FAM69BQ5VUD6 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
FAM69BQ5VUD6 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
FAM69BQ5VUD6 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
FAM69BQ5VUD6 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
FAM69BQ5VUD6 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
FAM69BQ5VUD6 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
FAM69BQ5VUD6 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
FAM69BQ5VUD6 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
FAM69BQ5VUD6 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
FAM69BQ5VUD6 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
FAM69BQ5VUD6 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
FAM69BQ5VUD6 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
FAM69BQ5VUD6 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
FAM69BQ5VUD6 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
FAM69BQ5VUD6 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
FAM69BQ5VUD6 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
FAM69BQ5VUD6 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
FAM69BQ5VUD6 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
FAM69BQ5VUD6 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
FAM69BQ5VUD6 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
FAM69BQ5VUD6 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
FAM69BQ5VUD6 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
FAM69BQ5VUD6 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
FAM69BQ5VUD6 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
FAM69BQ5VUD6 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
FAM69BQ5VUD6 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
FAM69BQ5VUD6 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms