Protein–RNA interactions for Protein: Q49AG3

ZBED5, Zinc finger BED domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED5Q49AG3 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ZBED5Q49AG3 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ZBED5Q49AG3 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ZBED5Q49AG3 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ZBED5Q49AG3 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ZBED5Q49AG3 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ZBED5Q49AG3 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ZBED5Q49AG3 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ZBED5Q49AG3 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ZBED5Q49AG3 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ZBED5Q49AG3 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ZBED5Q49AG3 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ZBED5Q49AG3 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ZBED5Q49AG3 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ZBED5Q49AG3 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ZBED5Q49AG3 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ZBED5Q49AG3 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ZBED5Q49AG3 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ZBED5Q49AG3 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ZBED5Q49AG3 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ZBED5Q49AG3 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ZBED5Q49AG3 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
ZBED5Q49AG3 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ZBED5Q49AG3 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ZBED5Q49AG3 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ZBED5Q49AG3 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ZBED5Q49AG3 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ZBED5Q49AG3 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ZBED5Q49AG3 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ZBED5Q49AG3 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ZBED5Q49AG3 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ZBED5Q49AG3 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ZBED5Q49AG3 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ZBED5Q49AG3 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ZBED5Q49AG3 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ZBED5Q49AG3 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ZBED5Q49AG3 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ZBED5Q49AG3 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ZBED5Q49AG3 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ZBED5Q49AG3 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ZBED5Q49AG3 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
ZBED5Q49AG3 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ZBED5Q49AG3 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ZBED5Q49AG3 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ZBED5Q49AG3 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ZBED5Q49AG3 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ZBED5Q49AG3 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ZBED5Q49AG3 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
ZBED5Q49AG3 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
ZBED5Q49AG3 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ZBED5Q49AG3 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ZBED5Q49AG3 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ZBED5Q49AG3 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ZBED5Q49AG3 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ZBED5Q49AG3 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ZBED5Q49AG3 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ZBED5Q49AG3 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ZBED5Q49AG3 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ZBED5Q49AG3 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ZBED5Q49AG3 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ZBED5Q49AG3 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ZBED5Q49AG3 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ZBED5Q49AG3 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ZBED5Q49AG3 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ZBED5Q49AG3 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ZBED5Q49AG3 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ZBED5Q49AG3 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ZBED5Q49AG3 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ZBED5Q49AG3 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ZBED5Q49AG3 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ZBED5Q49AG3 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ZBED5Q49AG3 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ZBED5Q49AG3 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ZBED5Q49AG3 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ZBED5Q49AG3 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ZBED5Q49AG3 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ZBED5Q49AG3 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ZBED5Q49AG3 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ZBED5Q49AG3 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ZBED5Q49AG3 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ZBED5Q49AG3 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ZBED5Q49AG3 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
ZBED5Q49AG3 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ZBED5Q49AG3 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ZBED5Q49AG3 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ZBED5Q49AG3 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ZBED5Q49AG3 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ZBED5Q49AG3 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ZBED5Q49AG3 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ZBED5Q49AG3 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
ZBED5Q49AG3 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ZBED5Q49AG3 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
ZBED5Q49AG3 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ZBED5Q49AG3 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ZBED5Q49AG3 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ZBED5Q49AG3 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZBED5Q49AG3 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZBED5Q49AG3 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZBED5Q49AG3 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZBED5Q49AG3 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms